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檢測步驟
Ι。活性Cdc42 Pull-Down實驗
1. 等分0.5-1 mL的細(xì)胞裂解物至微量離心管中。
2. 向管中加入1mL的1X Assay/Lysis 緩沖液。
3. 向管中加入1ul的活性Cdc42單克l隆抗l體。
4. 用渦旋振蕩儀將protein A/G凝膠柱充分混勻,然后快速的吸出20ul懸浮珠漿液加入離心管中。
5. 將管置于4°C條件下孵育1H,并輕輕的進(jìn)行搖動。
6. 5000g,離心1分鐘。
7. 棄上清,這一步要非常小心以避免珠子的損失。
8. 用0.5 mL的1X Assay/Lysis緩沖液洗滌珠子三次,離心并棄去上清。
9. 后一次洗滌后,小心的移去所有的上清。
10. 用20ul的2X SDS-PAGE樣品緩沖液重懸樣品。
11. 樣品煮沸5min。
12. 5000g,離心10s。
試劑盒成分
特異性識別Cdc42活性構(gòu)象的鼠單克l隆抗l體(Anti-active Cdc42, Mouse MonoclonalAntibody (Catalog No. 26905)):小管裝--30ul (抗l體濃度是1mg/ml),抗l體溶于PBS(pH7.4)并包含50%的甘油和0.05%的疊氮l化鈉。此抗l體可以特異性識別所有脊椎動物中的Cdc42-GTP。
Protein A/G agarose (Catalog No. 30301) :小管裝—400ul包含200ul Protein A/G agarose 和200ul 20%乙醇溶液。(使用時溶液需要充分混勻,再吸?。?/p>
5X Assay/Lysis Buffer (Catalog No. 30303):小瓶裝—30mL包含250 mM Tris-HCl (pH 8.0), 750 mM NaCl, 50 mM MgCl2, 5 mM EDTA, 5% Triton X-100。
特異性識別Cdc42活性構(gòu)象的兔多克l隆抗l體(Anti-Cdc42,rac1-GTP, Rabbit Polyclonal Antibody (Catalog No.21010)):小管裝--30ul (抗l體濃度是1mg/ml),抗l體溶于PBS(pH 7.4)并包含有 50%的甘油。
100 X GTPγS (Catalog No. 30302) :小管裝—100ul (10 mM) ,實驗中0.5mL細(xì)胞裂解液使用 5ul GTPγS標(biāo)記。
100 X GDP (Catalog No. 30304) :小管裝—100ul (100 mM) ,實驗中0.5mL細(xì)胞裂解液使用5ul GDP標(biāo)記。
試劑制備
1X Assay/Lysis Buffer:實驗前用去離子水將5X的Assay/Lysis緩沖液稀釋成1X的緩沖液,并在使用前加入蛋白酶抑制l劑如1 mM PMSF, 10 μg/mL leupeptin(亮肽素),或 10 μg/mL aprotinin(抑肽酶)。
樣品處理
貼壁細(xì)胞
1. 培養(yǎng)細(xì)胞密度達(dá)到大約80%-90%之間(直徑10 cm培養(yǎng)皿,~107個細(xì)胞),并用活性劑或抑制l劑進(jìn)行處理。
2. 吸去培養(yǎng)基并用冰冷的PBS洗滌兩次。
3. 向細(xì)胞中加入1X Assay/Lysis緩沖液(每個直徑10cm的組織培養(yǎng)皿中加入0.5-1mL)。
4. 將培養(yǎng)皿放置于冰上處理10-20分鐘。
5. 用細(xì)胞刮棒把細(xì)胞從培養(yǎng)皿下分離下來。
6. 將細(xì)胞裂解物轉(zhuǎn)入合適的管中并放置于冰上。
7. 如果核發(fā)生裂解,細(xì)胞裂解物可能會變得非常的粘稠并且難以吸取。當(dāng)這種情況出現(xiàn)時,將細(xì)胞裂解物用27?的注射l器針頭來回吸取3-4次,以破壞基因組DNA,從而避免上述情況的出現(xiàn)。
8. 4°C 12000 g, 離心10 min。
9. 收集上清(~1-2 mg總蛋白)并放置于冰上使用。如果樣品不立即使用,請將處理后的樣品存放于-70°C條件下。
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