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新技術(shù)提升蛋白質(zhì)結(jié)晶成功率
超構(gòu)材料21世紀(jì)初被提出,截至目前它仍然是非常活躍的前沿領(lǐng)域。其中的微結(jié)構(gòu),大小尺度與它作用的蛋白質(zhì)尺寸相當(dāng),蛋白質(zhì)結(jié)晶板價(jià)格,因此得以對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)晶過(guò)程施加干預(yù),對(duì)蛋白質(zhì)的聚集態(tài)形成起到促進(jìn)作用,從而降低了兩步成核中的步能壘。其次,通過(guò)材料本體結(jié)構(gòu)的晶格對(duì)聚集態(tài)蛋白質(zhì)分子進(jìn)行引導(dǎo)排列,促進(jìn)蛋白質(zhì)分子的有序排列和晶核形成,從而降低了兩步成核中的第二步能壘。
盡管通過(guò)實(shí)驗(yàn)和理論證明了超構(gòu)材料在蛋白質(zhì)結(jié)晶方面的巨大潛力,但要充分發(fā)揮其優(yōu)勢(shì)則必須兼容當(dāng)前蛋白質(zhì)結(jié)晶通過(guò)的高通量篩選系統(tǒng)。目前國(guó)際上普遍采用液體處理機(jī)器人來(lái)進(jìn)行高通量結(jié)晶篩選,篩選一個(gè)結(jié)晶條件的蛋白樣品消耗體積為納升級(jí)別。因此,如何快速,穩(wěn)定地將成核劑添加到高通量系統(tǒng)的同時(shí),又不對(duì)結(jié)晶系統(tǒng)造成大的影響成為急需解決的問(wèn)題。
隨后通過(guò)優(yōu)化生產(chǎn)和制備工藝,考察了各生產(chǎn)因素對(duì)成核劑尺寸和穩(wěn)定性的影響,確定了適合高通量蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選的成核劑混懸劑的制備工藝流程。這是一種含有具有表面超結(jié)構(gòu)的有機(jī)無(wú)機(jī)復(fù)合材料,其尺寸分布在幾百納米到幾微米之間。該產(chǎn)品的組成為材料顆粒與水溶液的混懸液。在蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選實(shí)驗(yàn)中,使用該產(chǎn)品有助于提高蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選的成功率,包括改善晶體的分辨率和篩選新的結(jié)晶條件,使不結(jié)晶或難結(jié)晶的蛋白質(zhì)成功結(jié)晶,展現(xiàn)了巨大的應(yīng)用潛力,使用該成核劑已經(jīng)成功結(jié)晶和解析十多個(gè)蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)。
此外,針對(duì)能夠結(jié)晶的蛋白質(zhì)分子,成核劑混懸液在篩選新的結(jié)晶條件,提升結(jié)晶的分辨率方面同樣有效。目前,先進(jìn)院已經(jīng)與國(guó)內(nèi)超過(guò)18個(gè)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展了合作,助力我國(guó)的生命科學(xué)和生物研究。
蛋白質(zhì)結(jié)晶技術(shù)發(fā)展的艱難歷程
科學(xué)家們研究蛋白質(zhì)結(jié)晶技術(shù)花費(fèi)了很長(zhǎng)時(shí)間。1988年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)被授予三位德國(guó)科學(xué)家,原因是三個(gè)人通力合作,蛋白質(zhì)結(jié)晶板哪家好,在世界上解析了一種膜蛋白——菌光合反應(yīng)中心的高分辨率三維結(jié)構(gòu),它拉開(kāi)了膜蛋白結(jié)構(gòu)生物學(xué)的序幕,在生物學(xué)界影響非常大。之后,科學(xué)家們?cè)诨蚪M學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域不斷取得新進(jìn)展,可以作為潛在靶向的蛋白質(zhì)的數(shù)量呈指數(shù)級(jí)增加,然而這些方法獲得有用晶體的成功率不足20%。
2011年,英國(guó)帝國(guó)理工學(xué)院和薩里大學(xué)的科學(xué)家們使用一種“分子印跡聚合物(MIPs)”的材料,研發(fā)出了一種更有效的制造蛋白質(zhì)晶體的方法。但是這種方法在結(jié)晶條件成分復(fù)雜,包含高鹽,寬泛的酸堿區(qū)間等條件下,容易造成MIPs對(duì)蛋白質(zhì)的印記作用失效。科研不斷深入,技術(shù)不斷迭代,目前,應(yīng)用為廣泛的晶體制備方法當(dāng)屬規(guī)模篩選,比如高通量蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選,即從成百上千個(gè)溶液條件中篩選出適合結(jié)晶的條件。據(jù)相關(guān)數(shù)據(jù)顯示,目前的高通量蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選的成功率僅為15.6%,嚴(yán)重制約了蛋白質(zhì)結(jié)晶技術(shù)在結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用和發(fā)展。缺乏、廣譜的蛋白晶體制備技術(shù)是目前結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究中的技術(shù)瓶頸。
近期,山東蛋白質(zhì)結(jié)晶板,由深圳先進(jìn)技術(shù)研究院喻學(xué)鋒研究員課題組研發(fā)的一種蛋白質(zhì)結(jié)晶篩選添加劑——人工晶種混懸液打破了技術(shù)桎梏。新法的應(yīng)用,能夠讓蛋白質(zhì)晶體的結(jié)晶更簡(jiǎn)便,更科學(xué),蛋白質(zhì)結(jié)晶板報(bào)價(jià),更完整。
蛋白結(jié)晶板使用
主要表現(xiàn)在2個(gè)方面:一是在傳統(tǒng)結(jié)晶方法和試劑基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的一系列新的的結(jié)晶技術(shù)和篩選試劑盒;二是從生物學(xué),物理學(xué)和化學(xué)等角度提出的一些提高結(jié)晶篩選效率的新技術(shù),主要包括通過(guò)分子工程改造蛋白,提高蛋白溶液的穩(wěn)定和均一性,導(dǎo)入籽晶,共結(jié)晶,改善結(jié)晶界面和變溫篩選等技術(shù).展望了該領(lǐng)域未來(lái)的發(fā)展趨勢(shì)。
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