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先進(jìn)院新技術(shù)提升蛋白質(zhì)結(jié)晶成功率
100多年前,吉布斯等人提出“經(jīng)典成核理論”,結(jié)晶過(guò)程是一些分子或原子偶然聚集在一起,碰巧以結(jié)晶形式排列,然后其他分子(原子)逐個(gè)附著,形成更大的結(jié)晶相,該結(jié)論得到了學(xué)術(shù)界廣泛認(rèn)可。
然而,經(jīng)典成核理論也有諸多缺點(diǎn),它表明蛋白質(zhì)晶體的成核并不是沿著經(jīng)典路線而是更復(fù)雜的路線進(jìn)行的,蛋白質(zhì)結(jié)晶板哪家好,即兩步法成核理論。步是形成足夠尺寸的溶質(zhì)分子團(tuán)簇,第二步是團(tuán)簇重新排列形成有序結(jié)構(gòu)。目前的實(shí)驗(yàn)和理論研究,證明了兩步法成核理論不僅可以應(yīng)用到生物大分子(如蛋白質(zhì))上還用到了有機(jī)小分子上,表明這一機(jī)理或許會(huì)成為大部分溶液析晶過(guò)程的基礎(chǔ)。在液滴內(nèi)從無(wú)序到有序結(jié)構(gòu)團(tuán)簇的形成,也就是第二步,決定晶體成核速率,由于這一步中分子復(fù)雜性增加,成核的時(shí)間變長(zhǎng),因?yàn)楦叨鹊臉?gòu)象靈活性,更復(fù)雜的分子形成佳晶格結(jié)構(gòu)會(huì)更困難。傳統(tǒng)的成核劑材料,蛋白質(zhì)結(jié)晶板報(bào)價(jià),如礦物晶體、石墨烯、多孔材料如多孔硅等都曾作為成核劑用于蛋白質(zhì)結(jié)晶實(shí)驗(yàn)中,這些成核劑的設(shè)計(jì)主要依賴于經(jīng)典的成核理論,無(wú)法適用于構(gòu)象靈活性強(qiáng)的絕大多數(shù)蛋白質(zhì)分子。針對(duì)這一難題,材料界面中心和武漢先進(jìn)院團(tuán)隊(duì)經(jīng)過(guò)不斷的設(shè)計(jì)和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,終將成核劑材料設(shè)計(jì)為具有超構(gòu)表面的材料。
蛋白結(jié)晶板概念
不能模擬形狀分布,因?yàn)槟P椭械木w尺寸被簡(jiǎn)單的定義為該晶體的體積當(dāng)量直徑.本提出了一個(gè)適用于蛋白質(zhì)結(jié)晶過(guò)程的基于晶體形狀結(jié)構(gòu)的群體粒數(shù)衡算模型.在該模型中,蛋白質(zhì)晶體的形狀被定量描述為每個(gè)晶面到晶體幾何中心的距離,由此提出了基于蛋白質(zhì)晶形的多維粒度分布,即形狀分布的概念.以溶菌酶結(jié)晶過(guò)程為例,蛋白質(zhì)結(jié)晶板多少錢(qián),對(duì)溶菌酶晶體結(jié)晶的熱力學(xué)和動(dòng)力學(xué)行為進(jìn)行了分析和研究,安徽蛋白質(zhì)結(jié)晶板,應(yīng)用非線性回歸的方法,確定了四方系溶菌酶的結(jié)晶動(dòng)力學(xué)方程參數(shù).結(jié)合本提出的基于晶體形狀結(jié)構(gòu)的群體粒數(shù)衡算模型,質(zhì)量衡算方程。
蛋白結(jié)晶板使用
主要表現(xiàn)在2個(gè)方面:一是在傳統(tǒng)結(jié)晶方法和試劑基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的一系列新的的結(jié)晶技術(shù)和篩選試劑盒;二是從生物學(xué),物理學(xué)和化學(xué)等角度提出的一些提高結(jié)晶篩選效率的新技術(shù),主要包括通過(guò)分子工程改造蛋白,提高蛋白溶液的穩(wěn)定和均一性,導(dǎo)入籽晶,共結(jié)晶,改善結(jié)晶界面和變溫篩選等技術(shù).展望了該領(lǐng)域未來(lái)的發(fā)展趨勢(shì)。
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