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水中微生物DNA提取試劑盒,樣本制備步驟。
步驟1. 樣本過濾
1.1 從試劑盒中小心取出濾膜。用水樣潤濕濾膜。
1.2 將濾膜放置在濾器中,并過濾必要體積的水樣。
步驟2. 菌體裂解
* 提前準備:預(yù)先將恒溫儀設(shè)置到70℃,將恒溫箱設(shè)置到37℃。
2.1將樣本過濾后的濾膜翻轉(zhuǎn)放置到試劑盒提供的IncubationDish(平皿)中。
2.2 吸取2mllysis buffer(裂解液),并加到濾膜上。
2.3 將濾膜浸泡在裂解液中,小心搖勻平皿并在37°C孵育30分鐘。
2.4 用平皿中的裂解液沖洗濾膜,并搖晃平皿10秒鐘。
2.5 將平皿中的400μl裂解液轉(zhuǎn)移至IncubationTube(孵育管),70°C孵育10分鐘。
2.6 樣本短暫離心,并加入400μl Binding Buffer(結(jié)合液),立即渦旋充分混勻,以防止DNA沉淀。請勿離心樣本,并立即進行下一步。
步驟3. DNA提取
3.1 將步驟2.6中的混合液(~800μl)轉(zhuǎn)移到CollectionTube(收集管)內(nèi)的SpinColumn(離心柱)中,小心液體不要沾到離心柱的邊緣。
3.2 離心柱離心≥10000× g,1分鐘。棄掉收集管中的液體。重新將離心柱插到原有的收集管中。
3.3 離心柱中加入500μl洗液1。離心≥10000×g,1分鐘。棄掉收集管中的液體。重新將離心柱插到原有的收集管中。
3.4 離心柱中加入500μl洗液2。離心≥10000×g,1分鐘。棄掉收集管中的液體。將離心柱插到一個新的收集管中。
3.5 zui大速度離心3分鐘,病毒核酸純化,以去除殘留的洗液2。
3.6 棄掉收集管。
3.7 吸取60μl已70℃預(yù)熱的洗脫液,直接加到離心柱的硅膠膜上。硅膠膜表面應(yīng)全部覆蓋洗脫液。
3.8 室溫靜置2分鐘,然后離心8000×g,2分鐘,以洗脫DNA。
3.9 樣本保存管中的洗脫液即包含DNA,可直接用于PCR,或儲存在2~8℃,可存放1周。長期儲存是在≤-18℃。
DNA提取過程中各種試劑的作用及原理
溶液III--3mol/L NaAc(pH4.8)溶液:
NaAc的水溶液呈堿性,為了調(diào)節(jié)pH至4.8,必須加入大量的冰醋酸。 所以該溶液實際上是NaAc-HAc的緩沖液。用pH4.8的NaAc溶液是為了把pH12.6的抽提液,調(diào)回pH至中性, 使變性的質(zhì)粒DNA能夠復(fù)性,并能穩(wěn)定存在。而高鹽的3mol/L NaAc有利于變性的大分子染色體DNA、 RNA以及SDS-蛋白復(fù)合物凝聚而沉淀之。前者是因為中和核酸上的電荷,減少相斥力而互相聚合.
適用于PCR研究的快速提取法:
1 田間剪取植株新鮮葉片5-10mg(約2cm長)左右,新鮮葉片放于1 5ml離心管中,存于冰盒中,根據(jù)樣品號貼上相應(yīng)的標簽。
2 用剪刀將葉片組織剪細(約0 5cm長)放在點穴式研板中。
3 加入400μlDNA提取緩沖液,用玻棒將葉組織研細,直到液體變成深綠色即可。
4 再加400μlDNA提取緩沖液,混合均勻,轉(zhuǎn)入一新的1 5ml離心管(貼上相應(yīng)的編號)。
5 加400μl氯1仿,混合均勻后,2400×g離心30s,將上清液轉(zhuǎn)入一支新的1 5ml離心管(貼上相應(yīng)的編號)。
6 加800μl無水乙醇,混勻,2400×g離心3min。棄上清。
7 70%乙醇沖洗,風(fēng)干。
8 用50μlTE緩沖液溶解,存于-20℃。
9 取1μl用于PCR分析。
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