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T5核酸外切酶在基因克隆中的優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**高效性**:T5核酸外切酶依賴性組裝(TEDA)方法在常規(guī)克隆中的效率與使用專有DNA聚合酶的商業(yè)In-Fusion方法相似,但高于使用T5核酸外切酶、PhusionDNA聚合酶和DNA連接酶的Gibson方法。2.**低成本**:TEDA方法每個(gè)反應(yīng)使用0.04U的T5核酸外切酶,價(jià)格為0.25美分,具有很高的成本效益。3.**簡(jiǎn)單性**:TEDA方法的反應(yīng)混合物非常簡(jiǎn)單,易于操作,這使得它在預(yù)算有限的實(shí)驗(yàn)室中尤其有用。4.**靈活性**:TEDA方法能夠組裝多個(gè)DNA片段,并在多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)進(jìn)行定點(diǎn)誘變,提供了一種靈活的克隆和突變方法。5.**陽(yáng)性克隆率**:使用T5核酸外切酶的無(wú)縫克隆技術(shù)可以確保100%的陽(yáng)性克隆率,這提高了實(shí)驗(yàn)的成功率。6.**協(xié)同作用**:在無(wú)縫克隆中,T5核酸外切酶與Phusion高保真DNA聚合酶和TaqDNA連接酶協(xié)同作用,通過(guò)切割、填補(bǔ)和連接三個(gè)步驟,高效地完成DNA片段的連接。7.**減少污染**:T5核酸外切酶可以降解堿裂解提取質(zhì)粒中的變性DNA,減少超螺旋DNA的污染,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。這些優(yōu)勢(shì)使得T5核酸外切酶成為基因克隆中一個(gè)非常有價(jià)值的工具,尤其是在需要高效、低成本和操作簡(jiǎn)便的實(shí)驗(yàn)環(huán)境中。Ultra-Long Master Mix 在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的應(yīng)用主要集中在需要擴(kuò)增長(zhǎng)片段DNA序列的場(chǎng)合。Recombinant Mouse CD155/PVR (His Tag)
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點(diǎn):1.**來(lái)源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來(lái)源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫?cái)U(kuò)增,如LAMP技術(shù),無(wú)需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒(méi)有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過(guò)程中可以校正一些錯(cuò)誤,但保真性相對(duì)較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫?cái)U(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長(zhǎng)片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫?cái)U(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。
在PCR產(chǎn)物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的應(yīng)用和優(yōu)勢(shì),但它不能完全替代其他酶。以下是一些替代酶和它們的特點(diǎn):1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈DNA的平末端、5'-突出末端或切口,從DNA鏈的3'-端釋放5'-單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段。-與Lambda核酸外切酶相比,ExoIII對(duì)具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶則對(duì)5'-磷酸化的雙鏈DNA有更高的活性。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP進(jìn)行“3'dA加尾”,以提高連接效率。-這種方法通過(guò)在PCR產(chǎn)物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),增加了與載體連接的可能性,從而提高克隆效率。3.**TOPO克隆載體**:-TOPO克隆載體含有共價(jià)連接的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I,可同時(shí)作為限制性內(nèi)切酶和連接酶。-與傳統(tǒng)PCR克隆載體相比,TOPO克隆載體具有更短的連接反應(yīng)時(shí)間、更高的克隆效率以及更簡(jiǎn)單的分子克隆實(shí)驗(yàn)方案。綜上所述,雖然Lambda核酸外切酶在特定情況下非常有用,但它不能完全替代其他酶。每種酶都有其獨(dú)特的特性和應(yīng)用場(chǎng)景,選擇合適的酶取決于具體的克隆需求和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。
核酸內(nèi)切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一種來(lái)自大腸桿菌的DNA損傷修復(fù)酶,具有以下特點(diǎn):1.**雙功能活性**:核酸內(nèi)切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**釋放受損嘧啶堿基**:N-糖基化酶活性可以釋放雙鏈DNA上受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一個(gè)脫嘌呤(apurinic,AP)位點(diǎn)。3.**切割A(yù)P位點(diǎn)**:AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端,產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。4.**識(shí)別并切除受損堿基**:核酸內(nèi)切酶VIII可以識(shí)別并切除多種受損堿基,包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲。5.**與EndonucleaseIII的區(qū)別**:雖然核酸內(nèi)切酶VIII與核酸內(nèi)切酶III相似,但核酸內(nèi)切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸內(nèi)切酶III具有β裂解酶活性。6.**應(yīng)用領(lǐng)域**:核酸內(nèi)切酶VIII可以應(yīng)用于單細(xì)胞凝膠電泳、NGS建庫(kù)中DNA損傷修復(fù)、酶法合成DNA中釋放DNA鏈、堿洗脫,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)進(jìn)行含U片段的克隆等。
T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對(duì)超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無(wú)法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個(gè)重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應(yīng)。7.**儲(chǔ)存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項(xiàng)**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用使得T5核酸外切酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應(yīng)用價(jià)值。FnCas12a可以識(shí)別不同的PAM序列,例如5'-TTN-3',這增加了它可以靶向的基因組區(qū)域 。Recombinant Human BST2 Protein,hFc Tag
E1通常被認(rèn)為是泛素化過(guò)程中的限速步驟,因?yàn)樗婕暗椒核氐募て鸷虯TP的水解。Recombinant Mouse CD155/PVR (His Tag)
嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)是一種熱穩(wěn)定的酶,它在高溫下(55-65°C)仍然保持活性,這使得它在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中非常有用,尤其是在需要高溫反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)中,如熱循環(huán)擴(kuò)增(PCR)。BstDNAPolymeraseI具有以下特性:1.**熱穩(wěn)定性**:BstDNAPolymeraseI在高溫下具有較高的穩(wěn)定性,適用于高溫反應(yīng)的實(shí)驗(yàn),如PCR。2.**3'到5'外切酶活性**:這種酶具有3'到5'外切酶活性,能夠切除DNA末端上的非特異性引物和雜交DNA,使其成為等溫?cái)U(kuò)增應(yīng)用的理想酶。3.**耐鹽性**:BstDNAPolymeraseI在高鹽條件下仍能保持穩(wěn)定活性,這在一些特殊的PCR應(yīng)用中非常有用。4.**等溫?cái)U(kuò)增**:由于其3'到5'外切酶活性,BstDNAPolymeraseI用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),這種技術(shù)能夠在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。5.**快速PCR**:由于其高溫穩(wěn)定性,BstDNAPolymeraseI也可用于快速PCR反應(yīng),縮短了實(shí)驗(yàn)時(shí)間。6.**高GC含量模板擴(kuò)增**:BstDNAPolymeraseI對(duì)高GC含量模板的擴(kuò)增效果較好,因此在一些難擴(kuò)增的模板中表現(xiàn)出色。Recombinant Mouse CD155/PVR (His Tag)
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