潔凈車間參照美聯(lián)邦標準FS209E以及日本JIS(9920-1989)標準進行設計建造。潔凈車間主要包括生產車間、灌裝車間以及陳化室等附屬車間。潔凈車間配備有美國麥克維爾中央空調、空氣過濾器、全自動智能語音風淋室等相關設備，凈化能力達到10萬級標準。人員進入潔凈工作區(qū)須經過兩次更衣，換穿經消毒滅菌的防靜電潔凈工作服、帽子、口罩及鞋，再用酒精對手進行消毒，經風淋室360度旋轉吸塵后方可進入相關潔凈工作區(qū)。物品則通過的物流傳遞窗經紫外線隔離滅菌后進出潔凈工作區(qū)。為杜絕潔凈工作區(qū)可能的細菌存在，每天生產前要進行兩個小時全封閉臭氧滅菌。

化妝品廠潔凈車間的分區(qū)一般化妝品廠潔凈車間可大致分為三個區(qū)域：一般作業(yè)區(qū)、準清潔區(qū)、清潔作業(yè)區(qū)。

⊙一般作業(yè)區(qū)（非清潔區(qū)）：一般的原料、成品、工具儲存區(qū)域，包裝成品轉運區(qū)域等原料、成品風險較低的區(qū)域，如外包裝室、原輔料倉庫、包裝材料倉庫、外包裝車間、成品倉庫等。

⊙準清潔區(qū)：要求次之，如原料處理、包材處理、包裝、緩沖間（拆包間）、一般生產加工間、內包裝間等成品處理但不直接的區(qū)域。

⊙清潔作業(yè)區(qū): 指衛(wèi)生環(huán)境要求，人員、環(huán)境要求較高，必須經過消毒和更衣才可以進入，如：原料、成品的處理區(qū)域，冷卻間、待包裝儲存間、內包裝間等。

建有潔凈車間的化妝品工廠在選址、設計、布局、建設和改造時應避免污染源、交叉污染、混料和差錯的發(fā)生。

廠區(qū)環(huán)境整潔、和物流走向合理。

應有適當門禁措施，防止未經批準人員的進入。

保存建設和施工的竣工資料

生產過程中發(fā)生空氣污染較為嚴重的建筑，應建設在廠區(qū)常年風向的下風側。

相互有影響的生產工藝，不宜設在同一建筑物內時，各自生產區(qū)域之間應有有效的隔斷措施。生產發(fā)酵產品應具備發(fā)酵車間。