擴增檢測實驗室原則上分為4個單獨的工作區(qū)域：試劑儲存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應(yīng)混合物配制和擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染，進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行。

 雖然這些污染對PCR實驗結(jié)果的影響已經(jīng)受到了廣泛重視，多數(shù)實驗室對污染控制都采取了各種辦法，比如定期大掃除清理、劃分操作區(qū)域、試劑分裝、操作謹慎、重復實驗、多角度驗證結(jié)果。但是微量的核酸片段就能被擴增，所以對污染物的控制不僅僅是做到這些就能夠杜絕和避免的，關(guān)鍵是需要從源頭控制。

 檢測過程對可能出現(xiàn)的假陽性和假陰性進行質(zhì)量控制，除了檢測商品試劑盒所提供陽性和陰性對照外，每次臨床樣本檢測時，至少應(yīng)當有1份弱陽性和3份陰性質(zhì)控樣本（多份陰性質(zhì)控樣本設(shè)置對實驗室“污染”所致假陽性的監(jiān)控更為有效），隨機放在所檢測標本的中間。弱陽性質(zhì)控樣本可為檢測陽性的滅活稀釋后保存的臨床樣本、滅活病毒或假病毒顆粒等，如所采用的商品化試劑盒有“內(nèi)標”控制假陰性，或弱陽性質(zhì)控樣本來源困難，可暫不設(shè)弱陽性質(zhì)控。陰性質(zhì)控樣本采用標本采集管內(nèi)溶液即可。質(zhì)控樣本應(yīng)與臨床標本同等對待，參與樣本核酸提取和擴增檢測全過程。

 一個完整和有效的生化分析系統(tǒng)，由檢測儀器、試劑、校準品、及相關(guān)的操作程序、質(zhì)量控制程序、設(shè)備維護程序等組合而成。完整的分析系統(tǒng)有明確的系統(tǒng)性能驗證和方法特征，為實驗室規(guī)定了分析系統(tǒng)的適用范圍、樣本種類、配套試劑與校準物，及與檢驗結(jié)果質(zhì)量相關(guān)的方法特征：如線性范圍、精密度、準確度、干擾因素和參考范圍等。

 5.按照試劑儲存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)方向空氣壓力應(yīng)當以遞減的方式進行，使得PCR檢驗實驗室的空氣流向應(yīng)當按照試劑儲存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)方向進行，防止擴增產(chǎn)物順空氣氣流進入擴增前的區(qū)域?？諝饬飨驊?yīng)當為單向，禁止下游污染上游。應(yīng)當設(shè)置合理的壓差梯度，并安裝壓差監(jiān)測裝置，以有效證明空氣流向，壓差梯度不宜低于5帕。