微生物在農(nóng)業(yè)中的作用已經(jīng)逐漸被人們所認(rèn)識(shí)。目前，許多國(guó)家生產(chǎn)、施用和推廣微生物肥料。微生物肥料適用于多種經(jīng)濟(jì)作物、大田作物、果樹(shù)蔬菜、種苗花卉、藥材等。使用簡(jiǎn)單多樣，可用作基肥或追肥。一些菜農(nóng)認(rèn)為菌肥不能與化肥混合，混合后高濃度的化學(xué)物質(zhì)會(huì)滅菌肥料中的活性細(xì)菌，因此菌肥將失去其意義。事實(shí)上，沒(méi)有必要擔(dān)心這個(gè)問(wèn)題。菌肥中的微生物有很強(qiáng)的生命力。除了不適合與碳酸氫銨等堿性肥料和等生理堿性肥料混合外，與其他肥料混合還有許多優(yōu)點(diǎn)。

協(xié)助作物消化吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì):比如，根瘤菌能夠刺激性豆科植物植物的根產(chǎn)生腐病，使土壤中的氮能夠轉(zhuǎn)變成為作物能夠吸取的基肥。 提高植物抗病力(蟲(chóng)類(lèi)抵抗性):生物微生物中藥制劑中的微生物能夠在土壤中代謝素su、化肥和植物細(xì)胞生長(zhǎng)因子。素su和滅蟲(chóng)劑能夠殺掉植物病害的卵。植物細(xì)胞生長(zhǎng)因子推動(dòng)光合強(qiáng)度的提升，提升植物的呼吸作用工作能力。除此之外，它還能推動(dòng)植物造成很多乳酸脫氫酶、超氧化物歧化酶、酶等酶，進(jìn)而維持細(xì)胞質(zhì)的可靠性，提升植物防御力。 提高植物的抗逆性:在使用一些生物微生物劑后，他們?cè)谕寥乐泻芏嗌L(zhǎng)繁育，并集聚在作物根處產(chǎn)生優(yōu)點(diǎn)有益菌，在本身生長(zhǎng)發(fā)育歷程的并且還可以改進(jìn)周邊環(huán)境和植物的抗逆性。

復(fù)合微生物肥料改善了作物的營(yíng)養(yǎng)供給，特別是增加了有機(jī)質(zhì)、腐植酸、氨基酸等有機(jī)養(yǎng)分，有利于作物糖分的積累，提高了產(chǎn)品的含糖量，解決了部分施用化肥造成的“蔬菜不香，水果不甜”的問(wèn)題。施用復(fù)合微生物肥料可以降低農(nóng)產(chǎn)品中亞的含量，增加還原糖和維生素C的含量，大量的化肥和農(nóng)用肥料不同程度地污染了土壤，造成一定的毒性。生長(zhǎng)在污染土壤中的作物不僅會(huì)造成生長(zhǎng)障礙，還會(huì)給人類(lèi)帶來(lái)危害。消除土壤污染是環(huán)境控制的重要內(nèi)容。該復(fù)合微生物肥料肥效持續(xù)時(shí)間長(zhǎng)，可減少化肥用量，無(wú)毒無(wú)害。復(fù)合微生物肥料具有降解和轉(zhuǎn)化土壤中有毒物質(zhì)的能力。這種生物修復(fù)是各種土壤修復(fù)措施中一種經(jīng)濟(jì)有效的措施。

微生物菌劑的合理使用可以改善土壤結(jié)構(gòu)，減少肥料消耗，降低生產(chǎn)成本，提高作物質(zhì)量，增加產(chǎn)量，從而提高產(chǎn)品的經(jīng)濟(jì)效益。1.釋放土壤養(yǎng)分。微生物制劑含有大量有效細(xì)菌，可以將土壤中一些作物難以吸收的物質(zhì)轉(zhuǎn)化為可吸收利用的有效養(yǎng)分。有效菌分泌的胞外多糖是土壤團(tuán)聚體結(jié)構(gòu)的粘合劑，能增強(qiáng)土壤團(tuán)聚體結(jié)構(gòu)，疏松土壤，提高土壤滲透性和保水保肥能力，改善土壤養(yǎng)分供應(yīng)。2、提高肥料利用率。微生物制劑中的大多數(shù)有效細(xì)菌都能分解土壤中的有機(jī)物。腐植酸是有機(jī)物分解過(guò)程中產(chǎn)生的。土壤中的腐植酸和氮形成腐植酸銨，可以減少氮肥的流失。