土壤理化性狀的改善，加強了土壤有益微生物的活動，從而大限度促使有機物分解轉化，產(chǎn)生多種營養(yǎng)物質(zhì)和刺激性物質(zhì)，反過來又刺激微生物的生長發(fā)育，促進作物生長，達到增產(chǎn)增收的目的。國家對有機肥的生產(chǎn)十分重視，近幾年在政策方面給予傾斜來支持其發(fā)展。另外，功能性微生物在作物根系周圍形成優(yōu)勢種群，抑制或拮抗有害病原菌的生長繁殖，減輕了作物發(fā)生病害的程度，進而起到增加產(chǎn)量的作用。

肥料是指提供一種或一種以上植物必需的營養(yǎng)元素，改善土壤性質(zhì)、提高土壤肥力水平的一類物質(zhì)，是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的物質(zhì)基礎之一。主要包括磷酸銨類肥料、大量元素水溶性肥料、中量元素肥料、生物肥料、有機肥料、多維場能濃縮有機肥等。

隨著近代化學工業(yè)的興起和發(fā)展，各種化學肥料相繼問世。18 世紀中葉， 磷分為單元肥料（僅含一種養(yǎng)分元素）和復合肥料(含兩種或兩種以上養(yǎng)分元素)，前者如氮肥、磷肥和鉀肥；后者如氮磷、氮鉀和磷鉀的二元復合肥以及氮磷鉀三元復合肥。

有機肥料包括有機氮肥、合成有機氮肥等。中國習慣使用的有人畜禽糞尿、綠肥、廄肥、堆肥、漚肥和沼氣肥等。有機無機肥料即半有機肥料，是有機肥料與無機肥料通過機械混合或化學反應而成的肥料。

減少化肥的使用量和提高作物品質(zhì)使用微生物肥料后對于提高農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)，如蛋白質(zhì)、糖分、維生素等的含量上有一定作用，有的可以減少肖酸鹽的積累。應翻塘和添加綠肥及適量人糞尿、石灰等，以補充氧氣、低降碳氮比值、改善微生物的營養(yǎng)狀況，加速腐熟。在有些情況下，品質(zhì)的改善比產(chǎn)量提高好處更大。有機肥料有機肥料（manure） 天然有機質(zhì)經(jīng)微生物分解或發(fā)酵而成的一類肥料。中國又稱農(nóng)家肥。其特點有：原料來源廣，數(shù)量大；養(yǎng)分全，含量低；肥效遲而長，須經(jīng)微生物分解轉化后才能為植物所吸收；改土培肥效果好。常用的自然肥料品種有綠肥、人糞尿、廄肥、堆肥、漚肥、沼氣肥和廢棄物肥料等。

人糞尿人體排泄的尿和糞的混合物。此類產(chǎn)品要通過有機認證，并嚴格按照有機標準生產(chǎn)才可用于有機農(nóng)業(yè)。人糞約含70%～80%水分，20%的有機質(zhì)（纖維類、脂肪類、蛋白質(zhì)和硅、磷、鈣、鎂、鉀、鈉等鹽類及綠化物），少量糞臭質(zhì)、糞膽質(zhì)和色素等。人尿含水分和尿素、鹽、尿酸、馬尿酸、磷酸鹽、銨鹽、微量元素及生長素等。人糞尿中?；煊胁【拖x卵，施前應進行無害化處理，以免污染環(huán)境。人糞尿碳氮比（C/N）較低，極易分解；含氮素較多，腐熟后可作速氮肥用，作基肥或追肥均可，宜與磷、鉀肥配合施用。但不能與堿性肥料（草木灰、石灰）混用；每次用量不宜過多；旱地應加水稀釋，施后復土；水田應結合耕田，淺水勻潑，以免揮發(fā)、流失和使作物徒長。忌綠作物不宜用，以免影響品質(zhì)。