不過需注意注意的是，根據(jù)《公司登記管理條例》第三十六條規(guī)定，公司章程修改未涉及登記事項的，公司應(yīng)當(dāng)將修改后的公司章程或者公司章程修正案送原公司登記機關(guān)備案的規(guī)定，如非上市股份有限公司股權(quán)變更中因股東名稱變更而導(dǎo)致需修改公司章程的（實踐中有的地方規(guī)定股份公司需將股東名稱直接記載于章程上），則需要要去工商機關(guān)辦理修訂章程的備案，只是該等備案實際不登記不影響股東的權(quán)利行使。

《公司的法》除在第九條原則性規(guī)定了有限責(zé)任公司變更為股份有限公司外，并未就如何進行整體變更進行進一步規(guī)定。但在“第四章股份有限公司的設(shè)立和組織機構(gòu)”之“節(jié)設(shè)立”第九十五條中又規(guī)定：“有限責(zé)任公司變更為股份有限公司時，折合的實收股本總額不得高于公司凈資產(chǎn)額。有限責(zé)任公司變更為股份有限公司，為增加資本公開發(fā)行股份時，應(yīng)當(dāng)依法辦理。”

考慮到《公司的法》修改后對整體變更的操作缺乏具體規(guī)定及證監(jiān)會《公開發(fā)行證券公司信息披露的編報規(guī)則2號——公開發(fā)行證券的法律意見書和律師工作報告》中要求律師對發(fā)行人創(chuàng)立大會及各發(fā)起人股東所簽署的發(fā)起人協(xié)議等事項發(fā)表意見，且申報文件目錄中要求將發(fā)起人協(xié)議作為申報文件進行申報，出于謹慎性考慮和參照過往案例的習(xí)慣，目前A股的市場披露的整體變更方案一般還是參照1993年《公司的法》的要求按股份公司發(fā)起設(shè)立的方式執(zhí)行

根據(jù)《公司的法》的規(guī)定，以非貨幣資產(chǎn)出資的需要進行評估。因此，有觀點認為，整體變更以凈資產(chǎn)折股屬于非貨幣資產(chǎn)出資，需要進行評估。但是，《公司的法》規(guī)定的是需要就非貨幣“出資”進行評估，整體變更時的折股是否必然構(gòu)成“出資”行為尚有討論的空間。前文討論認為整體變更作為“變更”行為，其在變更過程中，企業(yè)的債權(quán)債務(wù)自然繼承，企業(yè)的資產(chǎn)也應(yīng)自然繼承，不會因為企業(yè)性質(zhì)變動而發(fā)生權(quán)利轉(zhuǎn)移。