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DNA測序檢測
1. PCR測序反應(yīng)
(1)取0.2ml的PCR管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,按下表加試劑:
所加試劑測定模板管標(biāo)準(zhǔn)對照管
BigDye Mix
1μl
待測的質(zhì)粒DNA
1μ 1
pGEM-3Zf ( )雙鏈DNA
-1μ1
待測DNA的正向引物
M13(-21)引物- 1μ 1
滅菌去離子水
2μ 1
總反應(yīng)體積5μ 1,不加輕礦物油或石蠟油,蓋緊PCR管,用手指彈管混勻,稍離心。
(2)將PCR管置于9600或2400型PCR儀.上進(jìn)行擴(kuò)增。98C變性2min后進(jìn)行PCR循環(huán),
PCR循環(huán)參數(shù)為96C 10s, 50C 5s, 60°C4min, 25 個循環(huán),擴(kuò)增結(jié)束后設(shè)置4C保溫。
2.乙醇法純化PCR產(chǎn)物
(1) 將混合物離心,將擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到1.5ml EP管中。
(2)加入25μ 1/乙醇混合液,充分振蕩,置冰上10min以沉淀DNA。12 000r/min于
4C離心30 min,小心棄上清。
(3)加70%(V/V)的乙醇50μ 1 洗滌沉淀2次。12 000r/min 于4C離心5min,小心棄上清和
管壁的液珠,真空干燥沉淀10~ 15min。
3.電泳前測序PCR產(chǎn)物的處理。
(1)加入12μ 1的TSR于離心管中,劇烈振蕩,讓其充分溶解DNA沉淀,稍離心。
(2)將溶液轉(zhuǎn)移至蓋體分離的0.2ml PCR管中,稍離心。
(3)在PCR儀上進(jìn)行熱變性(95C 2min),冰中驟冷,待_上機(jī)。
4..上機(jī)操作按儀器操作說明書安裝毛細(xì)管,進(jìn)行毛細(xì)管位置的校正,人工手動灌膠和建立
運行的測序順序文件。
5.儀器將自動進(jìn)行序列分析,并可根據(jù)用戶要求進(jìn)行序列比較。如測序序列已知,可通過
序列比較以星號標(biāo)出差異堿基處,提高工作效率。
6.測序完畢按儀器操作規(guī)程進(jìn)行儀器清洗與保養(yǎng)。
蛋白質(zhì)定量組學(xué)服務(wù)
細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對不同生命過程有重要影響。腺病毒包裝原理介紹腺病毒是一種沒有包膜的直徑為79-90nm的顆粒,由252個殼粒呈二十面體排列構(gòu)成。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達(dá)異常。目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記(label)策略和非標(biāo)記的(label free)定量策略,其中標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記(如 SILAC、15N 標(biāo)記),以及體外標(biāo)記(如 iTRAQ、TMT 標(biāo)記) 。
傳統(tǒng)的基于2D雙向凝膠電泳分離的蛋白質(zhì)組通常可以鑒定出約1000種蛋白,對全蛋白質(zhì)組的覆蓋僅在5~10%左右,不能滿足高通量定量蛋白質(zhì)表達(dá)譜分析的要求。結(jié)合在固相載體表面的抗原或抗ti仍保持其免yi學(xué)活性,酶標(biāo)記的抗原或抗ti既保留其免yi學(xué)活性,又保留酶的活性。我們結(jié)合樣品制備與高分辨率、高靈敏度的液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù),可在細(xì)胞與組織類樣品中鑒定直至多于10000個蛋白,對全蛋白質(zhì)組的覆蓋>60%。結(jié)合生物信息學(xué)分析,為您構(gòu)建高通量蛋白質(zhì)定量表達(dá)譜。
RNA提取及注意事項
研究基因的表達(dá)和調(diào)控時,需要從組織或細(xì)胞中分離純化RNA。RNA質(zhì)量的高低經(jīng)常影響RT-PCR、cDNA庫構(gòu)建和Northern Blot等分子生物學(xué)實驗的成敗。
主要試劑
Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,內(nèi)含異硫酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細(xì)胞,抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶。
1.
Trizol試劑含有,具有毒性和刺激性,注重操作。
2.
RNase污染的主要來源是操作過程中手和空氣中的浮沉,注重配帶手套,樣品盡可能蓋嚴(yán)。
3. 細(xì)胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全會降低后得率,因為一部分RNA會殘留在未裂解的細(xì)胞中。細(xì)胞裂解之后要看不見顆粒狀物質(zhì)(結(jié)締組織和骨除外)。在清洗和裂解細(xì)胞時在低溫下操作,防止在操作過程中釋放的內(nèi)源RNase降解了RNA。
4. 酵母和一些細(xì)菌由于細(xì)胞壁的特別結(jié)構(gòu),可以加入Trizol試劑同時加入無RNase的玻璃珠并劇烈振蕩,使細(xì)胞裂解充分。
2-8℃ 避光保存一年。