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活性氧檢測試劑盒(Reactive oxygen species assay kit)是一種利用熒光探針DCFH-DA進行活性氧檢測的試劑盒。在65℃恒溫水浴鍋中水浴30min,也可轉(zhuǎn)入37℃水浴12~24h,間歇振蕩離心管數(shù)次。DCFH-DA本身沒有熒光,可以自由穿過細胞膜,進入細胞內(nèi)后,可以被細胞內(nèi)的酯酶水解生成DCFH。而DCFH不能通透細胞膜,從而使探針很容易被裝載到細胞內(nèi)。細胞內(nèi)的活性氧可以氧化無熒光的DCFH生成有熒光的DCF。檢測DCF的熒光就可以知道細胞內(nèi)活性氧的水平。 本試劑盒提供了活性氧陽性對照試劑Rosup以便于活性氧的檢測。Rosup是一種混合物(compound mixture),濃度為50mg/ml。
一、注意事項
1、探針裝載后,一定要洗凈殘余的未進入細胞內(nèi)的探針,否則會導致背景較高。
2、探針裝載完畢并洗凈殘余探針后,可以進行激發(fā)波長的掃描和發(fā)射波長的掃描,以確認探針的裝載情況是否良好。
3、盡量縮短探針裝載后到測定所用的時間(刺激時間除外),以減少各種可能的誤差。
4、為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
單細胞RNA測序
單細胞RNA測序也稱scRNA-Seq。蛋白質(zhì)上樣濃度不要超過10mg/mL,否則會造成蛋白質(zhì)的聚集或沉淀。通常而言,一般的組織細胞RNA-seq實驗會產(chǎn)生1000萬個讀數(shù),如果一個基因的頻率超過50RPKM,即每百萬讀數(shù)中每千個堿基中超過50個,這一基因即被認為有表達。泊松分布下,1kb長的基因有超過500個讀數(shù)和4%的小變異系數(shù),即CV值;哺乳動物細胞通產(chǎn)含有200,000個mRNA,因此至少要用50個單細胞一起才能到達小CV值;考慮到逆轉(zhuǎn)錄的效率和環(huán)境干擾等因素,為得到準確的表達和細胞種類的識別,需要使用的細胞數(shù)量實際要更多。
◆ HPLC
如果合成的寡核苷酸應用于,定向誘變或定量的基因探測,那么對其純度要求較高。LncRNA芯片Longnon-codingRNAs(lncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt的功能性非編碼RNA分子。脫鹽或OPC純化的寡核苷酸可能達不到要求,則HPLC純化被廣泛地用于這個目的。作為一種純化樹脂,陰離子交換樹脂或反向樹脂被用于寡核苷酸純化。陰離子交換樹脂的HPLC通常顯示95-98%純化效率,對于達到35-mer寡核苷酸的純化是充分的。反向樹脂化的HPLC與陰離子交換樹脂的HPLC呈現(xiàn)相似的純化效率。因為HPLC的純化效率很大程度依靠寡核苷酸的長度,用HPLC法不能有效純化長的寡核苷酸(大于35-mer)。
◆ PAGE
對于長的寡核苷酸的純化(50-100mer),我們推薦PAGE純化法,它使用交連的聚酰胺凝膠(電泳)作為純化基質(zhì)。單核苷酸多態(tài)性(SNP)實驗SNP(SingleNucleotidePolymorphisn即單核苷酸多態(tài)性,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態(tài)性(Polymorphism)。盡管PAGE顯示出高的純化效率(>98%),但它在額外的步驟方面有一些缺陷,比如在PAGE之后需要提取和脫鹽,繼而將導致純化產(chǎn)率的下降。
3.引物的OD數(shù)如何定量?
答:引物合成引物OD數(shù)是這樣測定的:用紫外分光光度計,波長260nm,石英比色杯,光程為1厘米,測定溶液的光密度。除了文中提到了三個主流平臺,外顯子組捕獲方面的新產(chǎn)品也在不斷推出,研究人員的選擇也將更廣泛。測定時溶液的光密度好稀釋到0.2-1.0之間。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后,用1ml水稀釋測OD值。需要根據(jù)稀釋倍數(shù)換算出母液的OD值。
4.需要什么級別的引物?
答:引物常用的純化方式脫鹽、BioRP / OPC純化、PAGE純化、HPLC純化。根據(jù)實驗需要,確定訂購引物的純度級別。