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如何評(píng)價(jià)和選擇支原體檢測(cè)試劑盒
1. 靈敏度。
靈敏度常用支原體基因組的拷貝數(shù)或支原體菌株的CFU表示。
2. 特異性和廣譜性。
質(zhì)量好的試劑盒應(yīng)檢測(cè)的支原體物種越多越多,并且特異性強(qiáng),即只針對(duì)支原體,不針對(duì)其他細(xì)菌等微生物,沒有交叉反應(yīng)。
3. 穩(wěn)定性。
凍干粉比液體試劑的穩(wěn)定性高。
4. 樣本類型及樣本處理。
一款好的試劑盒,會(huì)標(biāo)出它適合的樣本類型,也會(huì)說明如何處理樣本。要注意有的樣本含有抑制PCR反應(yīng)的物質(zhì),因此需要處理。
5. 對(duì)照品。
一個(gè)好的試劑盒,會(huì)帶有陽性對(duì)照和內(nèi)控對(duì)照。內(nèi)控對(duì)照是用于監(jiān)測(cè)PCR是否正常。如果樣本含有抑制PCR的物質(zhì),則內(nèi)控對(duì)照的條帶會(huì)發(fā)生缺失。有嚴(yán)重支原體污染的樣本由于樣本中的支原體對(duì)內(nèi)控對(duì)照產(chǎn)生了競爭性抑制,因此支原體條帶越強(qiáng),內(nèi)控條帶越弱
核糖核酸(縮寫為RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物細(xì)胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經(jīng)磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個(gè)核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構(gòu)成。RNA的堿基主要有4種,即A(腺piao呤)、G(鳥piao呤)、C(胞C4H4N2)、U(尿C4H4N2),其中,U(尿C4H4N2)取代了DNA中的T。核糖核酸在體內(nèi)的作用主要是引導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成。
人體一個(gè)細(xì)胞含RNA約10pg(含DNA約7pg)。與DNA相比,RNA種類繁多,分子量較小,含量變化大。RNA可根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能的不同分為信使RNA和非編碼RNA。非編碼RNA分為非編碼大RNA和非編碼小RNA。非編碼大RNA包括核糖體RNA、長鏈非編碼RNA。非編碼小RNA包括轉(zhuǎn)移RNA、核酶、小分子RNA等。小分子RNA(20~300nt)包括 miRNA、 SiRNA、 piRNA、scRNA、 snRNA、 snoRNA等,細(xì)菌也有小分子RNA(50~500nt)。
植物DNA的CTAB提取法:
1 稱取新鮮葉片2-3g,剪碎放入研缽中,在液氮中研磨成粉末。
2 將粉末轉(zhuǎn)移到的加有7ml經(jīng)預(yù)熱的1 5×CTAB提取緩沖液15ml離心管中,迅速混勻后置于65℃水浴中,溫育30min。
3 取出離心管,冷卻至室溫,加入氯1仿/異戊1醇(24:1),充分混勻,室溫下2300×g離心20min。
4 將上清轉(zhuǎn)移至另一新的15ml離心管中,加入1/10體積10%的CTAB和等體積的氯1仿/異戊1醇。充分混勻,2300×g離心20min。
5 轉(zhuǎn)移上清至另一新的15ml離心管中,加入等體積1%的CTAB沉淀緩沖液,輕輕搖晃至形成DNA絮狀沉淀。1000×g離心10min,使DNA沉淀于管底。
6 加入1 5-2ml的1mol/LNaCl及5μlRNase置于56℃水浴中過夜。待DNA完全溶解后,加2-3ml4℃預(yù)冷的95%的冰乙醇使DNA沉淀,挑出DNA,置于1 5ml離心管中,用70%乙醇清洗30min,用離心機(jī)甩5s,倒出70%乙醇,再用95%乙醇浸泡5min,倒出95%乙醇,在超凈工作臺(tái)上吹干。
7 將風(fēng)干的DNA直接在4℃保存?zhèn)溆没蛉苡?00μlTE溶液中于-20℃保存。