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【從植物材料或植物培養(yǎng)細胞中提取基因組DNA】
① 按下表稱取適量的新鮮植物材料(如選用的是冷凍干燥植物材料,則用量減半),剪成小塊放入研缽中,加入液氮,待樣品冷凍完全后快速、用力研磨至粉末狀。研磨時應(yīng)間斷加入液氮以防止材料融化。
植物材料使用量 植物花、葉片10~100 mg 植物莖60~240 mg 植物根80~240 mg 植物種子80~240 mg 如選取植物的根、種子等樣品時,因其基因組DNA含量很低,需使用超過表格中所示的參數(shù)用量,此時請分兩管進行步驟1~6的實驗操作,在步驟7的操作中再將各管溶液分次加入至同一Spin Column中過濾,使各管的基因組DNA結(jié)合到同一個Spin Column上。如從培養(yǎng)的植物細胞中提取基因組DNA,請離心收集2×103~1×107的培養(yǎng)植物細胞,加入150 μl水充分懸浮細胞后移入研缽中,加入液氮后快速、用力研磨至粉末狀。
注)樣品研磨應(yīng)充分,否則將會嚴重影響基因組DNA的收率。
② 將研缽移至65℃水浴,當(dāng)樣品粉末剛開始融化時,向研缽中加入700 μl的Solution A和1.2 μl的RNase A1,用力碾磨30秒。
③ 收集650 μl研磨好的組織勻漿移至Collection Tube中。如勻漿體積不足650 μl,請補充Solution A至650 μl。65℃保溫15分鐘。注)處理富含纖維的根/莖等植物材料或富含淀粉、蛋白質(zhì)的種子等時,可延長水浴時間至60分鐘。
核糖核酸(縮寫為RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經(jīng)磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構(gòu)成。RNA的堿基主要有4種,即A(腺piao呤)、G(鳥piao呤)、C(胞C4H4N2)、U(尿C4H4N2),其中,U(尿C4H4N2)取代了DNA中的T。核糖核酸在體內(nèi)的作用主要是引導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成。
人體一個細胞含RNA約10pg(含DNA約7pg)。與DNA相比,RNA種類繁多,分子量較小,含量變化大。RNA可根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能的不同分為信使RNA和非編碼RNA。非編碼RNA分為非編碼大RNA和非編碼小RNA。非編碼大RNA包括核糖體RNA、長鏈非編碼RNA。非編碼小RNA包括轉(zhuǎn)移RNA、核酶、小分子RNA等。小分子RNA(20~300nt)包括 miRNA、 SiRNA、 piRNA、scRNA、 snRNA、 snoRNA等,細菌也有小分子RNA(50~500nt)。
植物DNA的SDS提取法:1 取2-3g新鮮葉片,在液氮中研磨成粉狀(防止溶化)后轉(zhuǎn)入15ml離心管中。2 加入5ml于65℃預(yù)熱的提取緩沖液,65℃水浴保溫30min(搖動數(shù)次),使提取液與樣品充分混合。3 加入2ml5mol/LKAc,劇烈振蕩,冰浴保溫20min以上。4 2700×g離心20min,將上清液倒入新的15ml離心管中,(若提?。模危劣糜冢樱铮酰簦瑁澹颍畹葘嶒?一般在轉(zhuǎn)移上清時加濾膜,防止樣品殘渣混入,可保證DNA純度)。5 加入4ml氯1仿/異戊1醇(24∶1),搖勻,平衡,2700×g離心15min。6 在另一新的15ml離心管中加入5ml預(yù)冷的異丙1醇,將上清液用移液槍轉(zhuǎn)入此管,在-20℃冷卻30min以上。7 2700×g離心10min,棄去上清液,用4ml70%乙醇洗滌,室溫保持10min。2700×g離心3min,倒去上清液。8 重復(fù)步驟7,用4ml70%乙醇洗滌,室溫保持10min。2700×g離心3min,倒去上清液。超凈工作臺內(nèi)吹干(3h左右)。9 加1mlTE緩沖液中溶解,加10μlRNase(10mg/ml),在37℃恒溫箱中溫育20min。10 再加100μl3mol/LNaAc和2ml無水乙醇,2700×g離心3min,倒去上清液。超凈工作臺內(nèi)吹干(3h左右)。11 將DNA沉淀溶于150μlTE中,置于超凈工作臺內(nèi)(3h左右)。將TE溶液轉(zhuǎn)入已滅菌的1 5mleppendorf管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?