擴(kuò)增檢測實(shí)驗(yàn)室原則上分為4個(gè)單獨(dú)的工作區(qū)域：試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染，進(jìn)入各個(gè)工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行。

 雖然這些污染對(duì)PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響已經(jīng)受到了廣泛重視，多數(shù)實(shí)驗(yàn)室對(duì)污染控制都采取了各種辦法，比如定期大掃除清理、劃分操作區(qū)域、試劑分裝、操作謹(jǐn)慎、重復(fù)實(shí)驗(yàn)、多角度驗(yàn)證結(jié)果。但是微量的核酸片段就能被擴(kuò)增，所以對(duì)污染物的控制不僅僅是做到這些就能夠杜絕和避免的，關(guān)鍵是需要從源頭控制。

 對(duì)結(jié)果有效性不利影響的因素可能包括但不限于：微生物污染、灰塵、電磁干擾、輻射、濕度、供電、溫度、聲音和震動(dòng)。舉個(gè)例子：一般使用的玻璃量器如移液管、容量瓶使用溫度都是在20℃，溫度過低或過高都會(huì)影響配制試劑濃度的度。實(shí)驗(yàn)室的溫度必須控制在（20±5）℃范圍內(nèi)才能確保檢測數(shù)據(jù)的誤差在可控范圍內(nèi)。除此之外實(shí)驗(yàn)室還應(yīng)保持良好的內(nèi)務(wù)管理，減少環(huán)境對(duì)檢測結(jié)果的影響。

 然而，并非所有學(xué)者都用得上這樣的網(wǎng)站。Garry Cooper在美國西北大學(xué)范伯格醫(yī)學(xué)院做博士后研究神經(jīng)生理學(xué)時(shí)，就沒有這樣的網(wǎng)站。2015年的一天，他正在幫忙清理實(shí)驗(yàn)室里的一臺(tái)冰箱，然后突然意識(shí)到需要這樣一個(gè)平臺(tái)：雖然他一直在把一些昂貴的試劑送給一個(gè)博士生，但是仍有大量被扔掉，那是一種常用但價(jià)格昂貴的研究工具，用于鑒定蛋白質(zhì)。

數(shù)據(jù)分析軟件：這是NGS實(shí)驗(yàn)室特有的環(huán)節(jié)，實(shí)驗(yàn)室需要用商品試劑配套的軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，并確認(rèn)使用軟件的版本和數(shù)據(jù)庫的現(xiàn)行有效版本；數(shù)據(jù)需要專業(yè)的生信人員進(jìn)行分析，需要在數(shù)據(jù)預(yù)處理、數(shù)據(jù)比對(duì)、數(shù)據(jù)質(zhì)控、分析判斷等每個(gè)流程進(jìn)行質(zhì)控，確保數(shù)據(jù)分析的準(zhǔn)確性。檢查人員強(qiáng)調(diào)，實(shí)驗(yàn)室安全關(guān)系到全監(jiān)測站每一位職工的安全，特別是有毒有害試劑的存放管理要嚴(yán)格、規(guī)范，有毒有害試劑的泄漏、流出和使用不當(dāng)均會(huì)帶來不可估計(jì)的損失，要做到“全覆蓋、零容忍”，堅(jiān)決杜絕有毒有害試劑事故的發(fā)生，確保職工的人身財(cái)產(chǎn)安全，維護(hù)單位工作環(huán)境和諧穩(wěn)定。