全自動生化分析儀時，儀器的交叉污染現(xiàn)象是引起實驗結(jié)果偏離的一個原因。由于全自動生化分析儀試劑針需要解除各種試劑，一般難以清洗干凈，所以容易造成分析項目的攜帶污染。而生化項目的測定往往需要僅幾微升樣本，試劑往往需要幾百微升 ，尤其在沒有自動清洗程序的流動池式生化分析儀上，由于前帶現(xiàn)象的存在，如果前一個人標本為高值樣本，則接后的個低值標本結(jié)果應慎重報告。

就是具有自動清洗程序的全自動生化分析儀也有交叉污染，例如Beckman 全自動生化分析儀CX4，它的試劑針(probe)、樣品吸樣針及反應攪拌棒是利用高壓沖洗洗液沖洗，然后用高壓壓縮空氣吹干，有時由于洗液壓力和壓縮空氣壓力偏低，使試劑吸針、樣品針及反應攪拌棒沖洗不干凈、吹不干，從而導致反應池之間相互污染、試劑間交叉污染，是檢驗結(jié)果偏離。另一個值得注意的問題是許多生化儀器由于長期頻繁的利用，使加樣針和試劑針的磨損加重或的“特氟龍”吸頭不及時更換，使吸樣針或試劑針密封層增大，產(chǎn)生泄露現(xiàn)象也是造成樣本間及實際間項目污染的一個重要原因。

在全自動生化分析儀使用中，我們發(fā)現(xiàn)一個項目會影響緊隨其后項目的測試結(jié)果，造成這種影響的原因之一是一種實際中含有另一試驗的測定物質(zhì)而直接干擾其測試結(jié)果。比如：在TP試劑中含有大量的CUSO4,如果將Cu放在TP項目的后面檢測，會使檢測結(jié)果偏高或重復性差。再如P放在含有磷酸鹽的項目后面，TBA放在含有膽酸鹽的項目后面都會使檢測結(jié)果偏高或重復性差。

近20年來生化分析發(fā)展快速。光譜技術已從單一的比色法發(fā)展為分光光度法、透射比濁法、原子吸收和火焰發(fā)射光譜法、分子熒光光譜法。分離技術除了一般的離心和超離心技術外，在層析和電泳技術方面有更廣泛的發(fā)展和應用。層析技術如薄層層析、凝膠層析、離心交換層析、親和層析、氣相層析、液相色譜（HPLC）等應用也越來越廣泛，特別是HPLC以其快速、高分辨率在微量代謝物、檢測方面更勝一籌。