病因尚無(wú)定論，目前主要有神經(jīng)系統(tǒng)損傷、腦的特定部位功能低下、多巴胺系統(tǒng)缺陷、遺傳、病毒感染和免疫缺陷等10余種觀點(diǎn)和假說(shuō)。特別需要指出的是，根據(jù)世衛(wèi)組織的介紹，現(xiàn)在并無(wú)證據(jù)顯示任何可能增加自閉癥患病風(fēng)險(xiǎn)。此前提示存在因果聯(lián)系的研究被發(fā)現(xiàn)研究方法存在嚴(yán)重缺陷。現(xiàn)有醫(yī)學(xué)手段還不能從根本上治好自閉癥。專家說(shuō)，2歲至6歲是自閉癥最為適佳的時(shí)機(jī)，越早療養(yǎng)效果越好。目前相關(guān)療法主要有行動(dòng)療法、藥物療法、食物療法和心理療法。

適當(dāng)教育設(shè)施漸受重視的同時(shí)，以行為學(xué)說(shuō)為基礎(chǔ)之式亦開(kāi)始發(fā)展，到了一九六Ｏ年代中期，制約理論已經(jīng)廣泛的被運(yùn)用在多種兒童問(wèn)題的療上，而自閉癥兒童經(jīng)由行為的隔離、消弱、懲罰、差別增強(qiáng)等方法而改善不當(dāng)?shù)男袨?，包括自傷、自我刺激、過(guò)動(dòng)、攻擊行為等。后來(lái)操作制約技巧開(kāi)始運(yùn)用在自閉癥患者其它能力的增進(jìn)，如生活自理、職能訓(xùn)練等，甚至更進(jìn)一步被運(yùn)用在社會(huì)人際互動(dòng)及語(yǔ)言溝通能力之訓(xùn)練上。

3歲的天天一個(gè)人玩的時(shí)候總是嘴里唧唧咕咕地說(shuō)個(gè)不停，有時(shí)候是對(duì)著書本或玩具說(shuō)。旁人也都聽(tīng)不清她說(shuō)什么，也弄不明白她在想些什么。媽媽很擔(dān)心，她究竟在跟誰(shuí)說(shuō)話？難道是得了自閉癥？其實(shí)，這樣的擔(dān)心是多余的。自言自語(yǔ)是3歲孩子中很普遍的正常現(xiàn)象。3歲，正是幼兒語(yǔ)言發(fā)展從外部語(yǔ)言過(guò)渡到內(nèi)部語(yǔ)言的關(guān)鍵階段，自言自語(yǔ)其實(shí)正是她將外部語(yǔ)言轉(zhuǎn)為內(nèi)部語(yǔ)言的一種表現(xiàn)，這其實(shí)是她們把內(nèi)心思考的內(nèi)容用語(yǔ)言表達(dá)了出來(lái)。

鑒于音樂(lè)療法關(guān)注的是人身心兩方面的整體調(diào)節(jié)，強(qiáng)調(diào)改善癥狀，提高人體自愈能力和生存質(zhì)量，而不是針對(duì)病原體和病灶。因此，音樂(lè)治理作為綜合療法的一部分或康復(fù)療理方法之一，可廣泛用于臨床各科病人。作為單獨(dú)的療方法，音樂(lè)療法主要用于功能失調(diào)和身心疾病患者如功能性血壓、功能性胃腸病，睡眠障礙，心境障礙（如抑郁焦慮性的障礙）和自閉癥等精神障礙患者的療法。