菌絲分解有機質(zhì)養(yǎng)分，實際上與動物一樣，是在不斷地進行呼吸作用，吸入氧氣而排出二氧化碳。如果菇房通風(fēng)不良，氧氣供應(yīng)不足，二氧化碳累積起來，一旦達到菇房內(nèi)空氣的1%，就有抑制子實體生長的作用；一旦累積到5%，則子實體不發(fā)生，已發(fā)生的也不能生長。此外，食用菌出菇架培養(yǎng)料本身發(fā)酵，也產(chǎn)生二氧化碳、阿摩尼亞氣和氣等，這些毒氣都能菌絲。在自然界中，這些毒氣隨時散入大氣中，或被雨水沖洗，不會造成危害。人工栽培時，必須加強菇房的通風(fēng)和消毒，隨時除去這些毒氣。

食用菌栽培袋也會立式置放在腔房間內(nèi)，沒有相對的出菇架將栽培袋固定不動，當架體產(chǎn)生晃動時，栽培袋非常容易從腔房間內(nèi)掉出，不僅會危害出菇室的自然環(huán)境，并且不利食用菌的處在適合的溫度和光照標準，而且目前的架體不可以開展旋轉(zhuǎn)的調(diào)整，查詢食用菌生長發(fā)育狀況及其菌類采收時，因為實際操作室內(nèi)空間的限定給職工實際操作產(chǎn)生麻煩。

食用菌的生長發(fā)育與光照這個因素有著不可或缺的因素，食用菌出菇架的出現(xiàn)，使得食用菌菌包可以充分的接受陽關(guān)照射，這樣較大程度上減免了和病蟲害的影響。不過不同種的食用菌對光照的接受程度不同，生長階段不同，需要的光照環(huán)境也不盡相同。相應(yīng)的光照可以促進食用菌生長，也可以對食用菌生長產(chǎn)生抑制效果，并且光照的作用是比價復(fù)雜的，野獸其他因素的影響。