珠的無機成分主要是碳酸鈣、碳酸鎂，占91%以上，其次為氧化硅、磷酸鈣、Al2O3及Fe2O3等。

珍珠中的有機物[3]含有門冬氨酸、蘇氨酸、絲氨酸、谷氨酸、甘氨酸、丙氨酸、胱氨酸、纈氨酸、蛋氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸、組氨酸、精氨酸、脯氨酸等17種氨基酸。 另外，還含有30多種微量元素、牛磺酸、豐富的維生素、肽類。

珍珠的形狀多種多樣， 有圓形、梨形、蛋形、淚滴形、紐扣形和任意形，其中以圓形為佳。非均質體。顏色有白色、 粉紅色、淡黃色、淡綠色、淡藍色、褐色、淡紫色、黑色等，以白色為主。白色條痕。具典型的 珍珠光澤，光澤柔和且?guī)в泻鐣炆?。透明至半透明。折光?.530－1.686，雙折射率：集合體不可測。無色散現象。硬度2.5－4.5。天然淡水珍珠的密度一般為2.66－2.78g/cm3，因產地不同而有差異。無解理。韌性較好。在短波紫外光下白色珍珠為淺藍色至淺黃色；黃色和金色珍珠為黃綠色，綠褐色至深棕色；黑珍珠為通常粉紅色到橙紅色；X射線下有淡黃白色的熒光。遇鹽酸起泡

   無瑕的珍珠理論上是不存在的，因為即使是肉眼難以看見，借助10倍甚至更高的放大鏡，還是可以看到珍珠表面就象月球表面一樣的紋路、凹凸不平。從實踐的角度來看，確實有一些珍珠用肉眼幾乎看不到或者極難看到任何瑕疵，由于并非搞科研，在商業(yè)應用領域，業(yè)內專家將之稱為無瑕。國家標準的《珍珠分級標準》里面，對“無瑕”的定義是“肉眼觀察表面光滑細膩，極難看到瑕疵”。請注意，前面不能加“100%”的定量厘定。至于說“無瑕”，從定性描述的角度、非嚴謹的場合是可以講的，但在產品級別厘定的嚴謹場合，則是不可以講的。