高新技術企業(yè)認定的程序如下:

(一)企業(yè)自我評價及申請

企業(yè)登錄"高新技術企業(yè)認定管理工作網"，對照本辦法第十條規(guī)定條件，進行自我評價。認為符合認定條件的，企業(yè)可向認定機構提出認定申請。

(二)提交下列申請材料

1. 高新技術企業(yè)認定申請書;

2. 企業(yè)營業(yè)執(zhí)照副本、稅務登記證(復印件);

3. 知識產權證書(獨占許可合同)、生產批文，新產品或新技術證明(查新)材料、產品質量檢驗報告、省級以上科技計劃立項證明，以及其他相關證明材料;

為扶持和鼓勵高新技術企業(yè)的發(fā)展，根據《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》(以下稱《企業(yè)所得稅法》)、《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》(以下稱《實施條例》)有關規(guī)定，制定本辦法。

健全內部控制制度

確保研究開發(fā)費用核算歸集的真實、準確。企業(yè)應按月對包括直接研究開發(fā)活動和可以計入的間接研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用進行歸集，并填寫企業(yè)年度研究開發(fā)費用結構明細表。對研究開發(fā)部門的各項費用建立輔助賬冊，進行單獨核算。(四)選擇參與高新技術企業(yè)認定工作的專家并報領導小組辦公室備案。具體來講應建立如下控制制度 。

折疊建立人工費用控制制度

員工的錄用、辭退應經過研究開發(fā)項目相關負責人批準，并編制研發(fā)人員名冊，準確核算人員費用。研究開發(fā)項目管理部門統計工時，負責工資計算的部門依據研究開發(fā)項目管理部門統計的工時和規(guī)定的工資標準制作工資表。企業(yè)應按月對包括直接研究開發(fā)活動和可以計入的間接研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用進行歸集，并填寫企業(yè)年度研究開發(fā)費用結構明細表。研發(fā)人員的工資表經過研究開發(fā)項目有關負責人簽署后報財務部門發(fā)放工資，財務部門依據各研究開發(fā)項目的工時統計計算各項目的工資費用。

建立材料工裝準備控制制度

財務部門在每月的月底處理完所有的研究開發(fā)項目的領料單、出庫單。財務部門和研發(fā)部門每月核對領料情況，財務部門作為研發(fā)費用記賬依據的原材料領用單必須經過研發(fā)部門有關負責人簽署。研發(fā)人員的工資表經過研究開發(fā)項目有關負責人簽署后報財務部門發(fā)放工資，財務部門依據各研究開發(fā)項目的工時統計計算各項目的工資費用。財務部門依據各研究開發(fā)項目的工裝準備費用單據計算各項目的工裝準備費用。