原位雜交是指將特定標記的已知順序核酸為探針與細胞或組織切片中核酸進行雜交，從而對特定核酸順序進行精0準確定量定位的過程。原位雜交可以在細胞標本或組織標本上進行。

原位雜交（in situ hybridization）將標記的核酸探針與細胞或組織中的核酸進行雜交，稱為原位雜交。

使用DNA或者RNA探針來檢測與其互補的另一條鏈在細菌或其他真核細胞中的位置。

原位雜交技術應用于染色體、細胞和組織切片等樣品中進行核酸特異性檢測，與免6疫組化技術的結合應用，能將DNA、mRNA和蛋白水平上的基因活性與樣品的顯微拓撲信息結合起來。1969年Pardue和Gall將放9射性標記的探針直接應用于純化核酸的雜交，此后得益于分子克6隆技術的發(fā)展，及不同探針標記系統(tǒng)和檢測系統(tǒng)的應用，大大增加了原位雜交檢測的應用靈活性和檢測靈敏度。

就DNA探針和RNA探針的比較，DNA探針在雜交過程中會出現(xiàn)探針雙鏈之間退火的可能，也更傾向于在溶液中形成大分子的探針聚合體，從而影響其滲透能力。而RNA 探針的應用，將提高DNA-RNA雜交子的熱穩(wěn)定性。

Tips：RNA探針因其單鏈、高分子結合力、可適應高溫雜交的特性，其檢測特異性和靈敏度均優(yōu)于DNA探針。常用的RNA探針標記方法為構建質粒后進行轉率合成。通過PCR擴增的方法，可以更方便地進行RNA探針的制備；RNA探針合成后，還需驗證其對目標片段檢測的靈敏度和特異性。

原位雜交組織（或細胞）化學技術簡稱原位雜交（In situ hybridization, ISH）是應用已知堿基順序并帶有標記物的核酸探針與組織細胞內待測的核酸，按堿基互補配對原則進行特異性結合，形成雜交體，然后用與標記物相應的檢測系統(tǒng)，通過組織化學或免3疫組織化學方法在核酸原有位置進行細胞內定位、定性和定量研究。為分子水平研究細胞內基因表達及有關細胞5因子的調控提供了有效的工具?？梢暈榻M織化學與免3疫組織化學的重大突破。

原位雜交不需要從組織中提取核酸，對于組織中含量極低的靶序列有極高的敏感性，并可完整地保護組織和細胞的形態(tài)，更能準確地反映出組織細胞的相互關系及功能狀態(tài)。