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原位雜交是指將特定標記的已知順序核酸為探針與細胞或組織切片中核酸進行雜交,從而對特定核酸順序進行精0準確定量定位的過程。原位雜交可以在細胞標本或組織標本上進行。
原位雜交(in situ hybridization)將標記的核酸探針與細胞或組織中的核酸進行雜交,稱為原位雜交。
使用DNA或者RNA探針來檢測與其互補的另一條鏈在細菌或其他真核細胞中的位置。
原位雜交是指將特定標記的已知順序核酸為探針與細胞或組織切片中核酸進行雜交,從而對特定核酸順序進行精3確定量定位的過程。原位雜交可以在細胞標本或組織標本上進行。
原位雜交技術(shù)(In situ hybridization,ISH)是分子生物學(xué)、組織化學(xué)及細胞學(xué)相結(jié)合而產(chǎn)生的一門新興技術(shù),始于20世紀60年代。
原位PCR;原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結(jié)合的技術(shù),在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結(jié)合原位雜交進行檢測的方法。
就DNA探針和RNA探針的比較,DNA探針在雜交過程中會出現(xiàn)探針雙鏈之間退火的可能,也更傾向于在溶液中形成大分子的探針聚合體,從而影響其滲透能力。而RNA 探針的應(yīng)用,將提高DNA-RNA雜交子的熱穩(wěn)定性。
Tips:RNA探針因其單鏈、高分子結(jié)合力、可適應(yīng)高溫雜交的特性,其檢測特異性和靈敏度均優(yōu)于DNA探針。常用的RNA探針標記方法為構(gòu)建質(zhì)粒后進行轉(zhuǎn)率合成。通過PCR擴增的方法,可以更方便地進行RNA探針的制備;RNA探針合成后,還需驗證其對目標片段檢測的靈敏度和特異性。
雜交技術(shù)zui重要的因素之一是選擇zui適的雜交反應(yīng)溫度。若反應(yīng)溫度低于Tm 10~15℃,堿基順序高度同源的互補鏈可形成穩(wěn)定的雙鏈,錯配對減少。若反應(yīng)溫度再低(Tm-30℃),雖然互補鏈之間也可形成穩(wěn)定的雙鏈,但互補堿基配對減少,錯配對增多、氫鍵結(jié)合的更弱。如兩個同源性在50%左右或更低些的DNA,調(diào)整雜交溫度可使它們之間的雜交率變化10倍,因此在實驗前必須首先確定雜交溫度。通常有三種溫度可供試驗,即zui適復(fù)性溫度、苛刻復(fù)性溫度及非苛刻復(fù)性溫度。溫度的選擇及溫度對雜交的影響見表18-3。
zui適復(fù)性溫度(Optimunm renaturation temperature, TOR):Tor =Tm –25℃
苛刻復(fù)性溫度:Ts = Tm – (10或15℃)
非苛刻復(fù)性溫度:Tns =Tm – (30或35℃)