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PCR實驗室平面布局
臨床基因擴(kuò)增檢測實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配置和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進(jìn)入各個工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)—標(biāo)本制備區(qū)—擴(kuò)增反應(yīng)混合物配置和擴(kuò)增區(qū)—擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。
三實驗室空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)設(shè)計及壓力控制
PCR實驗室并沒有嚴(yán)格的凈化要求,但是為了避免各個實驗區(qū)域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時,要嚴(yán)格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實驗區(qū)的壓力要求。1.試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)該實驗區(qū)主要進(jìn)行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。試劑和用于標(biāo)本制作的材料應(yīng)直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區(qū)并沒有嚴(yán)格的要求。2.標(biāo)本制備區(qū)該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為臨床標(biāo)本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、儲存及其加入至擴(kuò)增反應(yīng)管和測定RNA時cDNA的合成。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進(jìn)入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動。
為避免提取的核酸在柜內(nèi)反復(fù)循環(huán),造成標(biāo)本之間的交叉污染,出現(xiàn)假陽性結(jié)果,該區(qū)域配備的生物安全柜必須是B2型的。生物安全柜工作區(qū)垂直氣流全部來自實驗室,排風(fēng)經(jīng)過過濾器(www.rfilter.com)過濾后直接排至室外,不允許回到安全柜和實驗室中。
根據(jù)經(jīng)驗,如果實驗室內(nèi)配備生物安全柜,每配備一臺,實驗室的面積增加10m2;標(biāo)本制備區(qū)的面積宜在25m2~30m2之間。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進(jìn)入本區(qū)的氣溶膠污染。
擴(kuò)增室該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為DNA或cDNA擴(kuò)增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應(yīng)混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應(yīng)混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。
在巢式PCR測定中,通常在輪擴(kuò)增后必須打開反應(yīng)管,因此巢式擴(kuò)增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。
擴(kuò)增室主要配備PCR實驗室的核心儀器PCR儀,本文實例中使用了ABI7500和ABI9700兩種PCR儀。
在實驗室建造過程中,需要給PCR儀配備專門的UPS電源,以保證其正常工作。該區(qū)面積控制在15m2~20m2。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負(fù)壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應(yīng)在超凈臺內(nèi)進(jìn)行。建議采用5~10Pa壓差,在控制上比較容易實現(xiàn)。
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弱電、中央管理站
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信號源采用5G無線信號,并于實驗室內(nèi)預(yù)留信息點位,保證實驗數(shù)據(jù)信息傳輸暢通;
所有室外門設(shè)有門禁裝置,所有房間均設(shè)有監(jiān)控攝像頭,保證圖像監(jiān)控全覆蓋,并于弱電箱內(nèi)設(shè)有存儲裝置,并考慮將圖像通過5G信號傳至云存儲裝置;
在控制室設(shè)置一套完整的中央管理站系統(tǒng),用于系統(tǒng)的組態(tài)、編程、 故障診斷等,同時為管理人員實現(xiàn)集中操作并提供有效準(zhǔn)確的數(shù)據(jù),使實驗室各個設(shè)備形成有效合理的運行秩序,以達(dá)到能源的有效節(jié)約。
中央管理站應(yīng)具有系統(tǒng)動態(tài)圖像顯示,數(shù)據(jù)采集、能耗管理、報表打印,動力設(shè)備的啟停控制與監(jiān)視,各類參數(shù)的實時控制與監(jiān)視,設(shè)備非正常狀態(tài)報警,對實驗室各個子系統(tǒng)進(jìn)行綜合管理等功能。