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陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照的體外GTPγS/ GDP蛋白質(zhì)上樣量
注意:體內(nèi)細(xì)胞刺激將激l活可用Arf 6的大約10%,而體外GTPγS蛋白負(fù)載將激l活A(yù)rf 6的將近90%。
1,將0.5 ml每種細(xì)胞提取物等分到兩個(gè)微量離心管中(或使用1 μg純化的Arf 6蛋白)。
2,向每個(gè)試管中加入20 μl 0.5 M EDTA(終濃度為20 mM)。
3,將5 μl 100 XGTPγS(至100 μM,終濃度)加到一個(gè)試管中(陽(yáng)性對(duì)照)。
4,在第二個(gè)試管中加入5 μl 100 X GDP(至1 mM,終濃度)(陰性對(duì)照)。
5,在攪拌下將試管在30°C孵育30分鐘。
6,通過將試管放在冰上并添加32.5 μl 1 M MgCl2(至60 mM,終濃度)來停止加載。
Arl3(類似Arf的3)是一種ADP-核糖基化因子(Arf)家族蛋白,在N端延伸方面不同于大多數(shù)Arf家族成員。 Arl3的核苷酸交換是快速的,并且與脂質(zhì)和去污劑無關(guān)。 與GDT / GTP結(jié)合后,Arl3與一系列效應(yīng)蛋白相互作用,并調(diào)節(jié)這些效應(yīng)蛋白的活性,例如人類視網(wǎng)l膜基因4(HRG4),cGMP磷酸二酯酶的δ亞基(PDEδ)和Arl2的結(jié)合物(BART)。 Arl3還以可調(diào)節(jié)的方式結(jié)合微管,以通過與色素性視網(wǎng)l膜炎2(RP2)相互作用來改變胞質(zhì)分裂的特定方面。 有人提出,RP2與Arl3協(xié)同作用,將光感受器中的細(xì)胞膜和細(xì)胞骨架連接為細(xì)胞的一部分
9.收集上清液并在冰上存儲(chǔ)樣品(約1-2 mg總蛋白)以進(jìn)行中間使用,或?qū)⑵淅鋬霾⒈4嬖?70°C下以備將來使用。
檢測(cè)原理
武漢紐斯特生物技術(shù)有限公司的Cdc42活性檢測(cè)試劑盒主要是利用識(shí)別蛋白特異形態(tài)的Cdc42-GTP單克l隆抗l體特異性的去檢測(cè)細(xì)胞提取物或者體外的(樣品需要進(jìn)行GTPγS活化處理)活性Cdc42-GTP的水平。簡(jiǎn)言之,特異性識(shí)別Cdc42活化構(gòu)象的鼠單克l隆抗l體可以特異性結(jié)合細(xì)胞裂解液中的Cdc42-GTP活性蛋白,然后利用protein A/G將抗原抗l體的結(jié)合物吸附下來,再利用特異性識(shí)別Cdc42活化構(gòu)象的兔多克l隆抗l體進(jìn)行免l疫印跡分析進(jìn)行檢測(cè)。
電泳和轉(zhuǎn)膜
1. 取15ul樣品/孔上樣17%配體膠。
2. 按照制造商的說明進(jìn)行SDS-PAGE。
3. 按照制造商的說明將凝膠蛋白轉(zhuǎn)到PVDF或硝化纖l維素膜。
免l疫印跡反應(yīng)和檢測(cè)(所有步驟都是在室溫下進(jìn)行,并不斷攪拌)
1. 將PVDF膜浸入100%甲l醇15s,然后在室溫放置5 min晾干。
注意:如果使用的是硝化纖l維素膜,此步省略。
2. 封閉:用TBST緩沖液配制5%的脫脂牛奶或者3%BSA在室溫下孵育1H進(jìn)行封閉,并需要恒定振蕩。
3. 孵育一抗:用TBST緩沖液配制的5%脫脂牛奶或3%BSA稀釋特異性識(shí)別Cdc42活性構(gòu)象的兔多克l隆抗l體(稀釋比例為1:50-1:1000,主要根據(jù)樣品中含有的Cdc42蛋白的量),室溫下孵育1-2小時(shí),或者4°C條件下過夜孵育。
4. 用TBST緩沖液洗滌膜三次/5min。
5. 孵育二抗:(例如羊抗兔IgG-HRP),用TBST緩沖液配制的5%脫脂牛奶或3%BSA按1:1000稀釋比例稀釋后使用,室溫下孵育1小時(shí)并恒定振蕩。
6. 用TBST緩沖液洗滌膜三次/5min。
7. 使用實(shí)驗(yàn)者所選擇的檢測(cè)方法進(jìn)行顯色如ECL顯色法。