蛋白質(zhì)晶體板方法

蛋白質(zhì)晶體由蛋白質(zhì)分子有序排列的框架組成,其內(nèi)部富含溶劑(水)分子,外觀形貌多種多樣,其物理性質(zhì)與常規(guī)固態(tài)晶體相比有很大不同。我們針對蛋白質(zhì)晶體的一些物理性質(zhì)(包括低密度、機(jī)械性能、聲學(xué)、熱學(xué)、光學(xué)等性質(zhì)),進(jìn)行了研究進(jìn)展評述,并根據(jù)蛋白質(zhì)晶體的特殊物理性質(zhì),評述了人們發(fā)展出的從蛋白質(zhì)結(jié)晶液中區(qū)分蛋白質(zhì)晶體的方法。

蛋白質(zhì)晶體板使用

蛋白質(zhì)晶體同其他小分子物質(zhì)晶體一樣,是分子單元按一定順序堆積而成的空間點(diǎn)群,在外觀上表現(xiàn)為具有規(guī)則幾何形狀的固體物質(zhì).與無定形態(tài)相比,蛋白質(zhì)晶體具有較高的理化穩(wěn)定性和生物活性.目前,蛋白質(zhì)結(jié)晶方法主要有氣相擴(kuò)散法,透析法,分批結(jié)晶法等,其過程受pH值,溫度,飽和度等諸多因素影響。

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蛋白結(jié)晶板介紹

研究蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)的物理化學(xué)分支學(xué)科。蛋白質(zhì)分子是由上百或更多的α-氨基酸作為單體縮合而成的多肽（見肽）鏈構(gòu)成的。能構(gòu)成蛋白質(zhì)中多肽鏈的α-氨基酸總共有 20種L－氨基酸。

組成蛋白質(zhì)分子的α-氨基酸都是L-異構(gòu)體，其構(gòu)型見圖2。圖2每個(gè)氨基酸或其殘基中羧酸根α位上的碳原子 Cα直接與氫原子、氨基和側(cè)鏈R基相連。在L-異構(gòu)體中,從Cα向R 看 時(shí),按順時(shí)針順序排列是H、NH幦和COO。存在于蛋白質(zhì)分子中的20種氨基酸各以其側(cè)鏈R基而相區(qū)別。

甘氨酸的R基為一個(gè)氫原子，而其他氨基酸的R基分別為脂肪側(cè)鏈、帶羥基的脂肪側(cè)鏈、帶芳香環(huán)的側(cè)鏈、堿性側(cè)鏈、帶羧酸基的側(cè)鏈、帶酰胺基的側(cè)鏈和含硫側(cè)鏈等。

決定多肽鏈構(gòu)象的每個(gè)Cα原子參與的Cα-N和Cα-C單鍵旋轉(zhuǎn)角φ和Ψ。φ和Ψ為180°時(shí)，給出完全伸展的構(gòu)象，當(dāng)φ和Ψ都為0°時(shí)，將使左方肽中的N-H與右方肽中的C=O互相接觸（圖6）。角φ和Ψ以Cα給出的順時(shí)針方向?yàn)檎?。多肽鏈中的N-H和C=O基團(tuán)當(dāng)參與形成較強(qiáng)的氫鍵時(shí),氫鍵N-H…O長度約為2.80埃，而N→H與N→O之間的交角不超過30°。