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蛋白質(zhì)晶體板結(jié)構(gòu)
多肽分子中前一個(gè)殘基中羰基碳原子與后一個(gè)殘基中的氨基氮原子之間形成一個(gè)肽鏈。多肽分子以氨基端為頭,而以羧基端為尾。組成蛋白質(zhì)分子的α-氨基酸都是L-異構(gòu)體,其構(gòu)型見圖2。圖2每個(gè)氨基酸或其殘基中羧酸根α位上的碳原子 Cα直接與氫原子、氨基和側(cè)鏈R基相連。在L-異構(gòu)體中,從Cα向R 看 時(shí),按順時(shí)針順序排列是H、NH幦和COO。存在于蛋白質(zhì)分子中的20種氨基酸各以其側(cè)鏈R基而相區(qū)別。
蛋白質(zhì)晶體板
因而形核劑的使用對(duì)于難結(jié)晶蛋白或者起始濃度過低的蛋白質(zhì)結(jié)晶具有重要意義.隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,形核劑在蛋白質(zhì)結(jié)晶中的研究仍是結(jié)晶方法學(xué)領(lǐng)域的熱點(diǎn)問題.多孔微球?qū)Φ鞍踪|(zhì)分子的吸附作用有利于無(wú)序蛋白質(zhì)分子團(tuán)簇的形成,進(jìn)而促進(jìn)蛋白質(zhì)形核.添加多孔微球不但可以增加結(jié)晶條件篩選數(shù)。
綜述了雜質(zhì)對(duì)蛋白質(zhì)晶體生長(zhǎng)影響研究領(lǐng)域的進(jìn)展情況, 對(duì)可能的雜質(zhì)來源以及雜質(zhì)對(duì)結(jié)晶過程的影響進(jìn)行了介紹,重點(diǎn)介紹了和結(jié)晶蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)相似的雜質(zhì)分子的影響, 包括晶體成核、生長(zhǎng)形態(tài)、表面形貌、生長(zhǎng)動(dòng)力學(xué)、質(zhì)量等,以及雜質(zhì)在晶體中的重新分配。
蛋白結(jié)晶板
以蛋白質(zhì)晶體學(xué)為主要手段的結(jié)構(gòu)基因組學(xué)研究通常包括選靶、、表達(dá)、純化、晶體篩選與優(yōu)化、X射線衍射數(shù)據(jù)收集與結(jié)構(gòu)解析等步驟。其中,獲得滿足衍射數(shù)據(jù)收集要求的高質(zhì)量蛋白晶體是大的'瓶頸'。我們?cè)谌祟惣?xì)胞內(nèi)氯離子通道蛋白2(CLIC2)結(jié)構(gòu)與功能研究中發(fā)現(xiàn)用5,5'二硫雙-2-甲酸(處理,可以顯著提高CLIC2晶體質(zhì)量,成功收集了分辨率至2埃的衍射數(shù)據(jù)試劑作為一個(gè)檢測(cè)巰基化合物的經(jīng)典試劑,通常用在半胱氨酸或含量測(cè)定上。在蛋白晶體學(xué)領(lǐng)域里以獲得蛋白晶體為目的的試劑修飾例子實(shí)際并不多。我們將其應(yīng)用在蛋白結(jié)晶學(xué)領(lǐng)域,使用Ellman試劑修飾方法使蛋白晶體質(zhì)量得到有效改善。