邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)現(xiàn)有IlluminaNovaSeq6000、NextSeq500、Miniseq測(cè)序儀及QiagenGenereader等一站式臨床診斷測(cè)序平臺(tái)，目前已建立的常規(guī)檢測(cè)能力包括WGS、WES、mRNA-Seq，lncRNA-Seq，miRNA-Seq，靶向富集測(cè)序，單細(xì)胞基因組/轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，免疫組庫測(cè)序、慢病毒插入位點(diǎn)檢測(cè)等。平臺(tái)多次滿分通過國家衛(wèi)生部臨檢中心（NCCL）及美國病理學(xué)家協(xié)會(huì)（CAP）組織的室間質(zhì)評(píng)與能力認(rèn)證；已完成20+方法學(xué)開發(fā)與驗(yàn)證，支持40多個(gè)臨床實(shí)驗(yàn)，完成了數(shù)千例余例樣本的檢測(cè)。6、全外顯子組測(cè)序一種生物的外顯子序列的測(cè)序，外顯子測(cè)序需要將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕獲并富集后進(jìn)行測(cè)序；人的外顯子序列只占全部基因序列的1%，約30MB，是基因組的編碼序列；相對(duì)于基因組測(cè)序分析的信息量小，成本較低。7、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA的測(cè)序，廣義上包括mRNA、核糖體RNA，上海一體化邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義指所有mRNA的**。8、靶向測(cè)序作者：心平氣和鏈接：源：知乎著作權(quán)歸作者所有。商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系作者獲得授權(quán)，非商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)具體包括全套的Leica組織樣本制備系統(tǒng)，上海一體化邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)，Ventana，上海一體化邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)、Leica、DAKO等全自動(dòng)免疫組化儀。上海一體化邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)

    3、主要平臺(tái)提供方ABI公司三、二代測(cè)序簡介1、Roche454測(cè)序:454測(cè)序是大規(guī)模平行測(cè)序的開始。2003年底，454公司推出了基于焦磷酸測(cè)序法的超高通量基因組測(cè)序系統(tǒng)—(GS)。2005年454公司被羅氏診斷公司收購，之后優(yōu)化推出GenomeSequencerFLXSystem(GSFLX)。羅森博格博士是該技術(shù)的創(chuàng)始人,也是IonTorrent平臺(tái)的創(chuàng)始人。454平臺(tái)的突出優(yōu)勢(shì)是長讀長(400nt)，但準(zhǔn)確率低，成本高。是高通量測(cè)序的過渡。454測(cè)序技術(shù)的具體步驟為：（1）構(gòu)建測(cè)序文庫。將基因組DNA打碎成300～800個(gè)堿基片段后，在兩端加上錨定接頭；（2）PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增產(chǎn)生成千上萬個(gè)拷貝；（3）焦磷酸測(cè)序。復(fù)制過程中如果發(fā)生堿基互補(bǔ)配對(duì)，就會(huì)釋放1個(gè)焦磷酸，在一系列酶的催化下，釋放出熒光信號(hào)，會(huì)被CCD捕獲到。每個(gè)堿基反應(yīng)都會(huì)捕獲到1個(gè)熒光信號(hào)，由此一一對(duì)應(yīng)，模板的堿基序列由此獲得。作者：心平氣和鏈接：源：知乎著作權(quán)歸作者所有。商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系作者獲得授權(quán)，非商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。 遼寧標(biāo)準(zhǔn)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)利用數(shù)字PCR進(jìn)行低豐度突變研究等；提供循環(huán)腫l瘤DNA檢測(cè)，可檢測(cè)EGFR、ERBB2等Biomarker。

    商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系作者獲得授權(quán)，非商業(yè)轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。3、LifeTechnologiesSOLID：ABI于2007年底推出SOLID系統(tǒng)，之后不斷升級(jí)至SOLID4。SOLID測(cè)序過程中以連接反應(yīng)取代聚合反應(yīng)。具體測(cè)序流程為：（1）文庫制備：將基因組DNA打斷，在其兩頭加上接頭，構(gòu)建成文庫；（2）乳液PCR／磁珠富集。此過程與454測(cè)序技術(shù)類似；（3）微珠沉積；（4）連接測(cè)序；（5）數(shù)據(jù)分析。454測(cè)序、Solexa、Solid均是邊合成邊測(cè)序原理，454和Solid均有乳液PCR過程。IonTorrent:2007年454技術(shù)創(chuàng)始人羅森伯格創(chuàng)辦IonTorrent。LifeTechnologies于2010年收購了IonTorrent，同年推出個(gè)人化基因組測(cè)序儀PGM。2012年推出IonProton測(cè)序儀。Proton更側(cè)重人基因組、外顯子組、全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。PGM測(cè)序儀的設(shè)計(jì)是基于半導(dǎo)體芯片技術(shù)，在半導(dǎo)體芯片的微孔中固定DNA鏈，隨后依次摻入ACGT。隨著每個(gè)堿基的摻入，釋放出氫離子，在它們穿過每個(gè)孔底部時(shí)能被檢測(cè)到。不需要激光、照相機(jī)或標(biāo)記。現(xiàn)有平臺(tái):Solid3,Solid4(100G),IonPGM和IonProton。

    ABI/SOLiDSOLiD技術(shù)是由連接酶測(cè)序法發(fā)展而來，LerroyHood在上世紀(jì)80年代中期利用連接酶法設(shè)計(jì)了***臺(tái)自動(dòng)熒光測(cè)序儀。SOLiD以四色熒光標(biāo)記寡核苷酸的連續(xù)連接合成為基礎(chǔ)，取代了傳統(tǒng)的聚合酶連接反應(yīng)，可對(duì)單拷貝DN**段進(jìn)行大規(guī)模擴(kuò)增和高通量并行測(cè)序。Illumina/SolexaIllumina公司的第二代測(cè)序儀**早由Solexa公司研發(fā)，其同樣為邊合成邊測(cè)序，該技術(shù)在測(cè)序的過程中，加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標(biāo)記的dNTP，因?yàn)閐NTP的3'羥基末端帶有可化學(xué)切割的部分，它只容許每個(gè)循環(huán)摻入單個(gè)堿基，此時(shí)，用激光掃描反應(yīng)板表面，根據(jù)dNTP所帶的熒光讀取每條模板序列每一輪反應(yīng)所聚合上去的核苷酸種類，經(jīng)過“合成-清洗-拍照”的循環(huán)過程，**終得到目的片段的堿基排列順序。技術(shù)原理Roche/454Roche/454技術(shù)原理，并在片段兩端加上不同的接頭，或?qū)⒋郎y(cè)DNA變性后用雜交引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，連接載體，構(gòu)建單鏈DNA文庫。，將包含PCR所有反應(yīng)成分的水溶液注入高速旋轉(zhuǎn)的礦物油表面，形成被礦物油包裹的無數(shù)個(gè)小水滴，每一個(gè)小水滴即為一個(gè)**的PCR反應(yīng)空間，理想狀態(tài)下，每一個(gè)小水滴只包含一個(gè)DNA模板和一個(gè)磁珠，磁珠表面含有與接頭互補(bǔ)的DNA序列，經(jīng)過PCR擴(kuò)增后。 邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)嚴(yán)格按照IS013485標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定建立質(zhì)量體系。

    1977年，WalterGilbert和FrederickSanger發(fā)明了***臺(tái)測(cè)序儀，并應(yīng)用其測(cè)定了***個(gè)基因組序列，噬菌體X174，全長5375個(gè)堿基。由此開始，人類獲得了探索生命遺傳本質(zhì)的能力，生命科學(xué)的研究進(jìn)入了基因組學(xué)的時(shí)代，到至今為止的四十年時(shí)間內(nèi)，測(cè)序技術(shù)已取得了相當(dāng)大的發(fā)展，從***代發(fā)展到了第三代測(cè)序技術(shù)。Sanger所發(fā)明的測(cè)序方法被稱為***代測(cè)序技術(shù)，該技術(shù)直到現(xiàn)在依然被***使用，但是其一次只能獲得一條長度在700～1000個(gè)堿基的序列，無法滿足現(xiàn)代科學(xué)發(fā)展對(duì)生物基因序列獲取的迫切需求。高通量測(cè)序(High-ThroughputSequencing,HTS)是對(duì)傳統(tǒng)Sanger測(cè)序的革命性變革，其解決了一代測(cè)序一次只能測(cè)定一條序列的限制，一次運(yùn)行即可同時(shí)得到幾十萬到幾百萬條核酸分子的序列，因此也被稱為新一代測(cè)序(NextGenerationSequencing,NGS)或第二代測(cè)序。第二代測(cè)序技術(shù)雖然測(cè)序的通量**增加，但是其獲得單條序列長度很短，想要得到準(zhǔn)確的基因序列信息依賴于較高的測(cè)序覆蓋度和準(zhǔn)確的序列拼接技術(shù)，因此**終得到的結(jié)果中會(huì)存在一定的錯(cuò)誤信息。因此，科研人員又發(fā)明了第三代測(cè)序技術(shù)也稱為單分子測(cè)序技術(shù)，該技術(shù)在保證測(cè)序通量的基礎(chǔ)上，對(duì)單條長序列進(jìn)行從頭測(cè)序。 使用北歐免疫組化質(zhì)控中心NordiQC推薦的IHC抗體組合。廣東專業(yè)邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)創(chuàng)新服務(wù)

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)圍繞生物標(biāo)志物研究、伴隨診斷開發(fā)，建立了完善的核酸組學(xué)、蛋白組學(xué)、細(xì)胞組學(xué)技術(shù)平臺(tái)。上海一體化邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)

    降低引物的擴(kuò)增效率，也需要重新設(shè)計(jì)并合成引物。3、初次復(fù)合擴(kuò)增時(shí)，各個(gè)引物在反應(yīng)體系中的濃度均為μm；之后對(duì)引物濃度進(jìn)行調(diào)整，獲得進(jìn)行pcr擴(kuò)增時(shí)各個(gè)引物的**佳濃度。經(jīng)過上述步驟，獲得引物組合。引物組合由120條引物組成，用于檢測(cè)68個(gè)基因座。各個(gè)基因座的名稱、擴(kuò)增基因座對(duì)應(yīng)的引物名稱和引物的核苷酸序列依次見表1中第1列、第2列和第3列。進(jìn)行pcr擴(kuò)增時(shí)各個(gè)引物的**佳濃度見表1中第5列。表1各個(gè)基因座對(duì)應(yīng)的引物在hg38人類參考基因組(hg38人類基因組的信息見網(wǎng)址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物的長度和核苷酸序列詳見表2。各個(gè)str基因座的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物的長度范圍分布見圖1。表2三、基于二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)68個(gè)基因座的試劑盒的制備基于二代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)68個(gè)基因座的試劑盒包括引物混合物；引物混合物由步驟二制備的120條引物混合而成。實(shí)施例2、實(shí)施例1制備的試劑盒檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品2800m的str分型及其應(yīng)用一、實(shí)施例1制備的試劑盒檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品2800m的str分型1、dna樣本準(zhǔn)備取標(biāo)準(zhǔn)品2800m，用超純水稀釋，獲得濃度為1ng/μl的標(biāo)準(zhǔn)品2800m水溶液。2、pcr擴(kuò)增以標(biāo)準(zhǔn)品2800m水溶液為模板，采用實(shí)施例1步驟三制備的引物混合物進(jìn)行pcr擴(kuò)增，得到pcr擴(kuò)增產(chǎn)物。上海一體化邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)NGS平臺(tái)技術(shù)指導(dǎo)

邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究（蘇州）有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中，一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取，不斷制造創(chuàng)新的市場(chǎng)高度，多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)，在江蘇省等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑，成績讓我們喜悅，但不會(huì)讓我們止步，殘酷的市場(chǎng)磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志，和諧溫馨的工作環(huán)境，富有營養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新，勇于進(jìn)取的無限潛力，邁杰轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來，回首過去，我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績而沾沾自喜，相反的是面對(duì)競(jìng)爭(zhēng)越來越激烈的市場(chǎng)氛圍，我們更要明確自己的不足，做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備，要不畏困難，激流勇進(jìn)，以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家，共同走向輝煌回來！