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DNA限制性內(nèi)切酶酶切
影響條件:DNA純度、緩沖液、溫度條件及限制性內(nèi)切酶本身都會(huì)影響限制性內(nèi)切酶的活性。大部分限制性內(nèi)切酶不受RNA或單鏈DNA的影響。
處理方法:當(dāng)微量的污染物進(jìn)入限制性內(nèi)切酶貯存液中時(shí),會(huì)影響其進(jìn)一步使用,因此在吸取限制性內(nèi)切酶時(shí),每次都要用新的吸管頭。如果采用兩種限制性內(nèi)切酶,必須要注意分別提供各自的zui適鹽濃度。若兩者可用同一緩沖液,則可同時(shí)水解。若需要不同的鹽濃度,則低鹽濃度的限制性內(nèi)切酶必須首先使用,隨后調(diào)節(jié)鹽濃度,再用高鹽濃度的限制性內(nèi)切酶水解。也可在第yi個(gè)酶切反應(yīng)完成后,用等體積酚/氯1仿抽提,加0.1倍體積3mol/L NaAc和2倍體積無水乙醇,混勻后置-70℃低溫冰箱30分鐘,離心、干燥并重新溶于緩沖液后進(jìn)行第二個(gè)酶切反應(yīng)。
一般是以微生物屬名的第yi個(gè)字母和種名的前兩個(gè)字母組成,第四個(gè)字母表示菌株(品系)。例如,快切酶,從Bacillus amylolique faciens H中提取的限制性內(nèi)切酶稱為Bam H,在同一品系細(xì)菌中得到的識(shí)別不同堿基順序的幾種不同特異性的酶,可以編成不同的號(hào),如HindⅡ、HindⅢ,HpaI、HpaⅡ,MboI、MboⅡ等。
別名:restriction endonuclease簡(jiǎn)稱限制酶
酶反應(yīng):限制性內(nèi)切酶能分裂DNA分子在一限定數(shù)目的專一部位上。它能識(shí)別外源DNA并將其降解。
單位定義:在指明pH與37℃,在0.05mL反應(yīng)混合物中,1小時(shí)消化1μg的λDNA的酶量為1單位。
性狀制品不含非專一的核酸水解酶(由10單位內(nèi)切酶與1μg λDNA,保溫16小時(shí)所得的凝膠電泳圖譜的穩(wěn)定性表示),這類酶主要是從原核生物中分離出來的,迄今已經(jīng)從近300多種不同的微生物中分離出約4000種限制酶。
限制性內(nèi)切酶能特異地結(jié)合于一段被稱為限制性酶識(shí)別序列的DNA序列之內(nèi)或其附近的特異位點(diǎn)上,并切割雙鏈DNA。它可分為三類:
Ⅰ類和Ⅲ類酶在同一蛋白質(zhì)分子中兼有切割和修飾(甲1基化)作用且依賴于ATP的存在。Ⅰ類酶結(jié)合于識(shí)別位點(diǎn)并隨機(jī)的切割識(shí)別位點(diǎn)不遠(yuǎn)處的DNA,而Ⅲ類酶在識(shí)別位點(diǎn)上切割DNA分子,然后從底物上解離。
Ⅱ類由兩種酶組成: 一種為限制性內(nèi)切核酸酶(限制酶),它切割某一特異的核苷酸序列; 另一種為獨(dú)立的甲1基化酶,它修飾同一識(shí)別序列。Ⅱ類中的限制性內(nèi)切酶在分子克1隆中得到了廣泛應(yīng)用,它們是重組DNA的基礎(chǔ)。絕大多數(shù)Ⅱ類限制酶識(shí)別長(zhǎng)度為4至6個(gè)核苷酸的回文對(duì)稱特異核苷酸序列(如EcoRⅠ識(shí)別六個(gè)核苷酸序列:5"- G↓AATTC-3"),有少數(shù)酶識(shí)別更長(zhǎng)的序列或簡(jiǎn)并序列。Ⅱ類酶切割位點(diǎn)在識(shí)別序列中,有的在對(duì)稱軸處切割,產(chǎn)生平末端的DNA部分片段(如SmaⅠ:5"-CCC↓GGG-3");有的切割位點(diǎn)在對(duì)稱軸一側(cè),產(chǎn)生帶有單鏈突出末端的DNA部分片段稱粘性末端,如EcoRⅠ切割識(shí)別序列后產(chǎn)生兩個(gè)互補(bǔ)的粘性末端。
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