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梯度PCR儀
把一次性PCR擴(kuò)增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),PCR Buffer,通常12鐘溫度梯度,這樣的儀器就叫梯度PCR儀。
工作模式和原理同普通PCR儀一樣,它出了又普通PCR儀的功能外還多了一個梯度退火功能。DNA部分片段的擴(kuò)增對溫度的控制精度要求特別高,不同的DNA部分片段其退火溫度不一樣,通過計算DNA部分片段中的CG堿基的含量只能初步的判斷出zui優(yōu)退火溫度在 5℃范圍內(nèi),如果用普通PCR儀進(jìn)行研究,需重復(fù)擴(kuò)增很多次,然后做電泳進(jìn)行分析來確定zui優(yōu)退火溫度。而梯度PCR儀則只需要一次就可以完成,在節(jié)省了時間的同時提高了實驗的可靠性和準(zhǔn)確性。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴(kuò)增,這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間和經(jīng)費(fèi)。在不設(shè)置梯度的情況下,梯度PCR儀也可以做普通PCR擴(kuò)增。
該儀器主要應(yīng)用于科研,教學(xué)機(jī)構(gòu),醫(yī)學(xué)臨床研究,高等院校,病毒分析,疾控中心等。
PCR法不僅僅局限于分子生物學(xué),還因其簡便、迅速等特點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、法醫(yī)學(xué)、食品、環(huán)境衛(wèi)生檢驗、動植物檢驗等其它領(lǐng)域。Taq DNA聚合酶是PCR法普遍使用的聚合酶,但其具有如下局限性。
1. 可信度 (Fidelity):通常Taq DNA Polymerase的Fidelity并不高,PCR反應(yīng)有時會出現(xiàn)錯配 (Misincorporation) 現(xiàn)象,因而PCR克1隆、變異導(dǎo)入等實驗中,需加以注意。
2. 擴(kuò)增的DNA長度:使用Taq DNA Polymerase進(jìn)行PCR擴(kuò)增時,通??蓴U(kuò)增幾kb的DNA,超過10 kb則比較困難。這就給利用PCR進(jìn)行Mapping等Genome解析帶來麻煩。
3. 擴(kuò)增量:使用Taq DNA Polymerase進(jìn)行PCR產(chǎn)物克1隆及食品、環(huán)境衛(wèi)生檢驗等時,擴(kuò)增量常常達(dá)不到要求。為解決以上難題,Takara在對Polymerase、Buffer及反應(yīng)條件等進(jìn)行深入研究的基礎(chǔ)上,開發(fā)了LA PCR (Long and Accurate PCR) 技術(shù),運(yùn)用此技術(shù)可大量正確地擴(kuò)增長達(dá)40 kb 的DNA部分片段。LA PCR技術(shù)擴(kuò)展了PCR的應(yīng)用范圍,可在Genome解析、基因診斷、長片段 DNA的克1隆及變異導(dǎo)入等方面發(fā)揮優(yōu)勢。
pcr擴(kuò)增的原理
實驗方法原理
①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;
②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對結(jié)合;
③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在Taq酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留copy原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)1制鏈。
重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)1制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘, 2~3小時就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍。
典型的PCR包括高溫變性、低溫退火、中溫延伸三個步驟,通過將這一套過程不斷循環(huán),使DNA得以成百萬倍的擴(kuò)增。
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