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轉(zhuǎn)移RNA
轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)在蛋白質(zhì)合成過程中負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸、解讀mRNA遺傳密碼。tRNA占細(xì)胞總RNA的10%~15%,絕大多數(shù)位于細(xì)胞質(zhì)中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鑒定。
tRNA一級(jí)結(jié)構(gòu)具有以下特點(diǎn):
①是一類單鏈小分子RNA,長73~95nt(共有序列76nt),沉降系數(shù)4S。
②是含稀有堿基zui多的RNA,含7-15個(gè)稀有堿基(占全部堿基的15%~20%),位于非配對(duì)區(qū)。
③5′末端堿基往往是鳥piao呤。
④3"端是CCA序列,其中的腺苷酸常稱為A76,其3’—OH是氨基酸結(jié)合位點(diǎn)。
tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)
約50%堿基配對(duì),形成四段雙螺旋,與五段非配對(duì)序列形成三葉草形結(jié)構(gòu)。
該結(jié)構(gòu)中存在四臂四環(huán):
①氨基酸臂。
②二氫尿C4H4N2臂(DHU臂、D臂)和二氫尿C4H4N2環(huán)(DHU環(huán)、D環(huán)),特征是含二氫尿C4H4N2(DHU、D)。
③反密碼子臂和反密碼子環(huán),特征是反密碼子環(huán)含反密碼子。反密碼子5′端與尿苷酸連接,3′端與piao呤核苷酸連接。TΨC臂(T臂)和TΨC環(huán)(Ψ環(huán)),特征是TΨC環(huán)含胸腺C4H4N2核糖核苷酸T54假尿苷酸Ψ55胞苷酸C56。
④額外環(huán)3~21nt。
tRNA三級(jí)結(jié)構(gòu)呈L形,氨基酸結(jié)合位點(diǎn)位于其一端,反密碼子環(huán)位于其另一端,DHU環(huán)和TΨC環(huán)雖然在二級(jí)結(jié)構(gòu)中位于兩側(cè),但在三級(jí)結(jié)構(gòu)中卻相鄰。盡管各種tRNA的長度和序列不盡相同,但其三級(jí)結(jié)構(gòu)相似,提示三級(jí)結(jié)構(gòu)與其功能密切相關(guān)。
植物DNA的CTAB提取法:
1 稱取新鮮葉片2-3g,剪碎放入研缽中,在液氮中研磨成粉末。
2 將粉末轉(zhuǎn)移到的加有7ml經(jīng)預(yù)熱的1 5×CTAB提取緩沖液15ml離心管中,迅速混勻后置于65℃水浴中,溫育30min。
3 取出離心管,冷卻至室溫,加入氯1仿/異戊1醇(24:1),充分混勻,室溫下2300×g離心20min。
4 將上清轉(zhuǎn)移至另一新的15ml離心管中,加入1/10體積10%的CTAB和等體積的氯1仿/異戊1醇。充分混勻,質(zhì)粒提取試劑盒,2300×g離心20min。
5 轉(zhuǎn)移上清至另一新的15ml離心管中,加入等體積1%的CTAB沉淀緩沖液,輕輕搖晃至形成DNA絮狀沉淀。1000×g離心10min,使DNA沉淀于管底。
6 加入1 5-2ml的1mol/LNaCl及5μlRNase置于56℃水浴中過夜。待DNA完全溶解后,加2-3ml4℃預(yù)冷的95%的冰乙醇使DNA沉淀,挑出DNA,置于1 5ml離心管中,用70%乙醇清洗30min,用離心機(jī)甩5s,倒出70%乙醇,再用95%乙醇浸泡5min,倒出95%乙醇,在超凈工作臺(tái)上吹干。
7 將風(fēng)干的DNA直接在4℃保存?zhèn)溆没蛉苡?00μlTE溶液中于-20℃保存。
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