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限制酶分布區(qū)域
限制性核酸內(nèi)切酶分布極廣,幾乎在所有細菌的屬、種中都發(fā)現(xiàn)至少一種限制性內(nèi)切酶,多者在一屬中就有幾十種,例如在嗜血桿1菌屬中(Haemophilus)現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)的就有22種。有的菌株含酶量極低,很難分離定性;然而在有的菌株中,酶含量極高.如E. coli的pMB4(EcoRI酶)和H. aegyptius(Hal Ⅲ酶)就是高產(chǎn)酶菌株。據(jù)報道從10g的H. aegyptius的細胞中,能分離提純出可消化l0gλ噬菌體DNA的酶量。細菌是限制性內(nèi)切酶,尤其是特異性非常強的I類限制性內(nèi)切酶的主要來源。
幾種酶的比較及限制酶
1幾種酶的比較
(1)限制性內(nèi)切酶:作用于DNA分子,切割磷酸二酯鍵,形成黏性末端或平末端。
(2) DNA連接酶:作用于DNA分子片段,連接磷酸二酯鍵,形成重組DNA分子。
(3) DNA聚合酶:作用于脫氧核苷酸,連接磷酸二酯鍵,形成新的DNA分子。
(4)解旋酶:作用于DNA分子,作用于氫鍵,形成DNA分子的單鏈。
2.限制酶:
(1)一種限制酶通常只識別一種特定的堿基序列,但是有少數(shù)限制酶卻可以識別不止
一種堿基序列。
(2)不同限制酶也可以識別同-堿基序列;
(3)不同限制酶識別的堿基序列雖然不同,mRNA切割酶,但切出的末端也可能相互連接。
質(zhì)粒載體和外源DNA中限制酶切位點的性質(zhì)
如今,質(zhì)粒載體中限制酶切位點的種類極為繁多,因而通常都有可能找到某種帶限制酶切位點恰恰與外源DNA部分片段本身毫無二致的載體。這就具備一個不可1比擬的優(yōu)點,也應(yīng)是可以用相應(yīng)的限制酶消化重組質(zhì)粒崦回收外源DNA。另一種方案,則是把片段插入到載體中能產(chǎn)生匹配末端的任何位點中。例如,識別不同的六核苷酸的限制酶BamHl和BglⅡ產(chǎn)生具有相同突出末端的限制酶切片段,這樣用BglⅡ消化而制備的外源DNA部分片段可以克1隆到用BanHl消化的質(zhì)粒中。這通常會使接合序列不能被曾用于外源DNA或制備載體的任何一種酶所切開。然而很多清況下,用切點位于多克1隆序列側(cè)翼的限制酶進行消化,可將片段從重組質(zhì)粒中摘出。偶爾在質(zhì)粒的以及外源DNA兩端的限制酶切位點之間,不可能找到“門當(dāng)戶對”的搭配關(guān)系。這時可用下面兩種方案加以解決:
1)在線狀質(zhì)粒末端和(或)外源DNA部分片段的末端接上合成在接頭或銜接頭。
2)在得到控制的反應(yīng)條件下,用大腸桿1菌DNA聚合酶I Klenow片段部分補平帶3凹端的DNA部分片段。如第九章所討論,這樣常可以使那些不相匹配的限制酶切位點轉(zhuǎn)變?yōu)榛パa末端,從而促進載體和外源DNA的連接。因為部分補平的反應(yīng)消除了同一分子兩端彼此配對的能力,故連接反應(yīng)過程中環(huán)化和自身寡聚化的機會也會有所降低
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