液相色譜儀是屬于易學(xué)難用的儀器，特別講究“正確使用”和經(jīng)驗。液相工作者接觸多的是流動相，流動相也是造成液相色譜各種問題的主要源頭。液相色譜常見的故障一是堵，二是漏。下面就這兩分別展開討論（流動相以甲1醇為例，色譜柱以C18為例） 。

 為何會堵?

“堵”的表現(xiàn)現(xiàn)象就是柱壓異常升高，直接原因就是流路不暢。堵塞的主要位置就是在色譜柱的前端，主要原因就是流動相里有雜質(zhì)，雜質(zhì)的主要來源就是細(xì)菌。

低壓色譜（LPLC）柱壓一般低于5bar（或75psi）。 低壓色譜一般是由蠕動泵、進樣閥和檢測器組成，可以連續(xù)化，實現(xiàn)自動的梯度淋洗和餾分收集等操作。色譜柱管一般是玻璃或聚合物材料的，長度一般為240-440mm，內(nèi)徑為10-40mm。 對于大多數(shù)在紫外區(qū)有吸收的物質(zhì)，光學(xué)檢測器很常用。等所有問題解決后，將色譜柱出口從瓶中取出，保證柱端口無溶劑殘留，再進行下一步的安裝。填料一般使用軟質(zhì)的葡聚糖、瓊脂糖、纖維素、合成高聚物或離子交換劑，粒徑一般為40-60μm。

液相色譜儀所用基本概念是保留值、塔板數(shù)、塔板高度、分離度、選擇性等與氣相色譜一致。液相色譜所用基本理論：塔板理論與速率方程也與氣相色譜基本一致，但由于在氣相色譜中以液體代替氣相色譜中氣體作為流動相，而液體和氣體的性質(zhì)不相同。液相色譜所用的儀器設(shè)備和操作條件也與氣相色譜不同，所以，液相色譜與氣相色譜有一定的差別。主要有以下幾方面：　　1、操作條件及應(yīng)用范圍不同：　　對于氣相色譜，是加溫操作。另一種不當(dāng)就是致命的錯誤：滑絲，這往往是動手能力不太強，螺絲釘很少擰的工作者犯的錯誤，滑絲的后果不僅是漏液那么簡單，常造成重要部件的報廢。僅能分析在操作溫度下能汽化而不分解的物質(zhì)，對高沸點化合物、非揮發(fā)性物質(zhì)、熱不穩(wěn)定化合物、離子型化合物及高聚物的分離、分析較為困難，致使其應(yīng)用受到一定程度的限制，據(jù)統(tǒng)計只有大約20%的機物能用氣相色譜分析?！　《合嗌V是常溫操作，不受樣品揮發(fā)度和熱穩(wěn)定性的限制，它非常適合相對分子量較大，難汽化，不易揮發(fā)或?qū)崦舾械奈镔|(zhì)、離子型化合物和高聚物的分離分析，大約占有機物的70%~80%。

色譜法分類

按兩相的物理狀態(tài)可分為：氣相色譜法(GC)和液相色譜法(LC)。氣相色譜法適用于分離揮發(fā)性化合物。GC根據(jù)固定相不同又可分為氣固色譜法(GSC)和氣液色譜法(GLC)，其中以GLC應(yīng)用廣。液相色譜法適用于分離低揮發(fā)性或非揮發(fā)性、熱穩(wěn)定性差的物質(zhì)。這樣就造成樣品在進行色譜分離的時候，會吸附或者鍵合在這部分硅羥基上，導(dǎo)致色譜峰拖尾。LC同樣可分為液固色譜法(LSC)和液液色譜法(LLC)。此外還有超臨界流體色譜法(SFC)，它以超臨界流體(界于氣體和液體之間的一種物相)為流動相(常用CO2)，因其擴散系數(shù)大，能很快達到平衡，故分析時間短，特別適用于手性化合物的拆分。

按原理分為吸附色譜法(AC)、分配色譜法(DC)、離子交換色譜法(IEC)、排阻色譜法(EC，又稱分子篩、凝膠過濾(GFC)、凝膠滲透色譜法(GPC)和親和色譜法。(此外還有電泳。)

按操作形式可分為紙色譜法(PC)、薄層色譜法(TLC)、柱色譜法。