不同的氣流組織直接影響施工的難易程度及工程造價。一般潔凈度級別高于5級的潔凈室均采用單向流，其中以垂直單向流，但造價也。流速太大將使室內積塵飛揚，造成污染。系統(tǒng)的氣密性不僅通風系統(tǒng)本身要求氣密性好，對建筑各部結合處、水暖電工藝管穿越圍護結構處也應堵嚴，防止?jié)B漏?？刂圃摽臻g的溫度、潔凈度、壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動及照明、靜電。

 純水、特氣、物料供應系統(tǒng)；廢氣、廢水處理系統(tǒng)及相關設施。運行管理包括：實時檢測，人員培訓，設備維護，以保證受控的生產(chǎn)科研環(huán)境持續(xù)符合要求。凈化工程的施工又區(qū)別于一般的建筑工程，包括圍護結構(俗稱“房中房”)；空調凈化系統(tǒng)；供電、自控、弱電系統(tǒng)。使相關產(chǎn)品和服務能夠在一個滿足要求的、受控的、良好的環(huán)境空間中進行生產(chǎn)和操作，從而達到提高產(chǎn)品生產(chǎn)的良品率，改善和提升相關服務質量的目標。

 給排水管道穿過潔凈室墻壁、樓板和頂棚時，應設套管，套管內管段不得有接頭，管道和套管之間必須用不起塵的密封材料封閉。為了進一步防止室內潔凈空氣通過排水管向外滲漏，同時也為防蟲防鼠，潔凈區(qū)排水出戶管末端在接到室外檢查井之前，往往還增設水封井。近些年來，各大城市主要陸續(xù)新建、改建，增設或改造了原有的凈化系統(tǒng)，這是我國經(jīng)濟發(fā)展、科技進步和醫(yī)衛(wèi)生水平提高的反映。